ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gigaspora margarita mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016684	CTT	4	935	947	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016684	CTT	4	1166	1176	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016684	CTA	4	8548	8558	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37229127
4	NC_016684	GAAA	4	9456	9471	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016684	TACCA	3	10329	10342	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016684	GGTT	3	11190	11202	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016684	ACA	5	11271	11284	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016684	CT	6	12748	12759	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016684	GAAA	3	13906	13918	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016684	TTAC	3	15301	15311	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37229128
11	NC_016684	GAT	4	16268	16278	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37229128
12	NC_016684	TC	6	17241	17251	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37229128
13	NC_016684	TATC	3	17512	17523	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37229128
14	NC_016684	AAAG	3	18554	18565	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37229128
15	NC_016684	CCAA	3	19860	19872	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	37229128
16	NC_016684	GAT	4	21021	21031	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37229128
17	NC_016684	AG	6	23059	23069	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37229128
18	NC_016684	CCCTT	3	24110	24124	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	37229128
19	NC_016684	G	12	25453	25464	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	37229128
20	NC_016684	GAA	4	27312	27323	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	37229128
21	NC_016684	TAGCA	4	29575	29593	19	40 %	20 %	20 %	20 %	10 %	37229128
22	NC_016684	GCGG	3	31192	31202	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	37229128
23	NC_016684	TTTA	3	31874	31886	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37229128
24	NC_016684	ATAAG	3	32313	32326	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	37229128
25	NC_016684	AG	6	32662	32672	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37229128
26	NC_016684	AGCA	3	33779	33791	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	37229128
27	NC_016684	TCTT	3	34452	34463	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37229128
28	NC_016684	GGGC	3	34658	34669	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	37229128
29	NC_016684	TCA	4	35283	35294	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	37229128
30	NC_016684	CTTC	3	36430	36441	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37229128
31	NC_016684	GAGT	3	37182	37192	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37229128
32	NC_016684	TTGG	3	37982	37994	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	37229128
33	NC_016684	AAG	4	39487	39497	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37229128
34	NC_016684	TTAAGG	3	40588	40606	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	37229128
35	NC_016684	TTAA	3	40838	40849	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37229128
36	NC_016684	CCAA	3	43138	43150	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	37229128
37	NC_016684	CTT	4	44631	44641	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37229128
38	NC_016684	GCC	4	49041	49051	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	37229128
39	NC_016684	CTAG	3	49357	49367	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37229128
40	NC_016684	GCAA	3	52249	52259	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016684	AGGGA	4	52470	52490	21	40 %	0 %	60 %	0 %	4 %	Non-Coding
42	NC_016684	CCT	4	52849	52859	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016684	CTT	4	56311	56322	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016684	GCAA	3	57265	57275	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016684	CTCTT	3	58382	58396	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016684	AAAGG	4	59801	59820	20	60 %	0 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016684	GGAA	3	59865	59876	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016684	TCAT	3	60445	60455	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016684	AAG	4	61119	61129	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016684	AGCAT	3	61628	61641	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016684	CAGG	3	63659	63670	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016684	GCGG	3	64560	64570	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016684	TACT	3	65294	65304	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016684	GTTAA	3	65621	65634	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016684	C	12	65918	65929	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016684	C	14	68995	69008	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016684	TTCCC	5	69080	69104	25	0 %	40 %	0 %	60 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016684	GCCC	3	69528	69538	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016684	TCCC	3	70157	70167	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016684	AGTTT	3	70686	70700	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016684	GCAA	3	71001	71013	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016684	GGGC	3	71203	71213	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016684	CAA	4	72133	72144	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37229127
64	NC_016684	TAAG	3	75004	75015	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016684	TTC	4	75633	75644	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016684	TTC	4	75802	75813	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016684	AGAA	3	77940	77951	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016684	TAGC	3	78351	78362	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016684	C	14	78952	78965	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016684	ATGG	3	79181	79191	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016684	CCCT	3	80158	80169	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016684	CCTT	3	82366	82377	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37229127
73	NC_016684	TCT	4	84870	84881	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37229128
74	NC_016684	CTT	4	85186	85196	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37229128
75	NC_016684	CTA	4	85874	85884	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016684	ATCA	3	86865	86876	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016684	CCAA	3	86880	86892	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016684	AACC	3	87366	87376	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016684	AGA	4	87694	87705	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016684	TCTA	3	88473	88484	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016684	AG	6	89384	89395	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37229127
82	NC_016684	AGA	4	90500	90510	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37229127
83	NC_016684	GCCC	3	91948	91958	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Gigaspora margarita mitochondrion