ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Leersia tisserantii plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016677	CAG	4	675	686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424924
2	NC_016677	TTA	4	5969	5979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016677	TAA	5	6354	6367	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016677	TAA	4	8102	8113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016677	GAA	4	8503	8514	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016677	GGA	4	10526	10536	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	37424925
7	NC_016677	TTG	4	10810	10820	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	37424925
8	NC_016677	ATT	4	16344	16356	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016677	TAT	4	17746	17756	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016677	ATA	4	17896	17907	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016677	CTA	4	20071	20082	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016677	ATT	4	20173	20183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016677	AGA	4	21165	21176	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424925
14	NC_016677	AAC	4	23818	23829	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37424925
15	NC_016677	AAT	4	25506	25517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37424925
16	NC_016677	GAA	4	28921	28932	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424925
17	NC_016677	ATT	4	30700	30712	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016677	AGA	4	31183	31193	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37424926
19	NC_016677	GTT	5	32376	32390	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	37424926
20	NC_016677	TGC	4	33335	33346	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37424926
21	NC_016677	TAG	5	37047	37061	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016677	TCC	4	37999	38010	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016677	ATG	4	39436	39446	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37424926
24	NC_016677	CTT	4	48881	48892	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016677	GAA	4	59625	59637	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016677	TTC	4	61831	61842	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37424927
27	NC_016677	ATA	4	64164	64174	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016677	TCT	4	64457	64467	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016677	TTA	4	64673	64684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016677	AAG	4	65584	65596	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016677	TAA	4	68203	68213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016677	AGA	4	75708	75719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424929
33	NC_016677	TAT	4	76765	76775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424929
34	NC_016677	TTC	4	82892	82902	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37424929
35	NC_016677	ATA	4	88640	88650	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424929
36	NC_016677	TAC	4	90457	90468	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424929
37	NC_016677	AAG	4	104594	104605	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37424932
38	NC_016677	CTA	4	108950	108961	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37424932
39	NC_016677	CAA	4	109761	109771	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	37424932
40	NC_016677	ATA	4	110546	110558	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37424932
41	NC_016677	TAT	4	110600	110610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37424932
42	NC_016677	TAA	4	115952	115962	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37424932
43	NC_016677	GTA	4	127950	127961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37424932

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Leersia tisserantii plastid