ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium darwinii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016670CAATA3462946441660 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
2NC_016670ATTTT3487248851420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_016670TTTTA3494649601520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_016670CTTAT3981498291620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
5NC_016670ATTCT310014100271420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
6NC_016670TTTCT31274712760140 %80 %0 %20 %7 %37229108
7NC_016670TTTTA330035300491520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016670TAATT344871448841440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_016670TATTT350698507121520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
10NC_016670AGAAT350797508111560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
11NC_016670GTTTT35131951332140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
12NC_016670TTATT351565515781420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_016670ATTCT354330543431420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
14NC_016670TAGAA354369543821460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
15NC_016670TTAAT454732547501940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
16NC_016670TTTCA358213582281620 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
17NC_016670TTTTC46467064689200 %80 %0 %20 %10 %Non-Coding
18NC_016670TTATA379557795701440 %60 %0 %0 %7 %37229107
19NC_016670CACTT384346843591420 %40 %0 %40 %7 %37229107
20NC_016670TATCA386413864281640 %40 %0 %20 %6 %37229107
21NC_016670ATATG390825908391540 %40 %20 %0 %6 %37229107
22NC_016670AACGG392409924221440 %0 %40 %20 %7 %37229107
23NC_016670GAAAG398589986041660 %0 %40 %0 %6 %37229107
24NC_016670TCCGG39945699470150 %20 %40 %40 %6 %37229107
25NC_016670TTCTA51044721044952420 %60 %0 %20 %8 %37229109
26NC_016670TAAAG51096521096762560 %20 %20 %0 %8 %37229109
27NC_016670AGAAA31143891144041680 %0 %20 %0 %6 %37229109
28NC_016670AAATA31239851239981480 %20 %0 %0 %7 %37229109
29NC_016670TTCTT3126960126974150 %80 %0 %20 %6 %37229109
30NC_016670CTATT31307951308091520 %60 %0 %20 %6 %37229109
31NC_016670ATATT31318051318191540 %60 %0 %0 %6 %37229109
32NC_016670ACTTT41395911396102020 %60 %0 %20 %5 %37229109
33NC_016670ACCGG31497921498061520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
34NC_016670CTTTC3150659150674160 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
35NC_016670CATAC31510691510821440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding