ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium darwinii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016670ATT5489449081533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016670TGT449614971110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016670GTT450585068110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016670TAA4668766981266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016670AAT4670567161266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016670TAT4842684371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016670AAT413597136081266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_016670TTA417253172641233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016670ATG418303183141233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37229102
10NC_016670TAA423995240051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229102
11NC_016670GTT42442724438120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229102
12NC_016670GAA427873278841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016670TAT428554285641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016670TTA437177371881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016670ATA538348383631666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016670ATA538407384221666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016670TAA438491385011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016670ATA444986449981366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016670TAG446654466641133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229103
20NC_016670AAT448544485541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016670TAA449769497811366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_016670ATT550461504741433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016670TTA453494535051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016670CAA453999540091166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_016670CTT45578955800120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_016670ATT562626626401533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016670CTT46570165712120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229104
28NC_016670AAT467657676681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016670ATA467774677841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_016670TCT46931069322130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016670ATT671641716591933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
32NC_016670ATA572216722291466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016670CTT47827278282110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229107
34NC_016670ATA488606886171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229107
35NC_016670CTT48900489015120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229107
36NC_016670GAT489476894861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229107
37NC_016670GAT490868908781133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229107
38NC_016670AGA494587945971166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229107
39NC_016670TTC4103880103891120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229109
40NC_016670GAA51145701145841566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229109
41NC_016670AAG41191701191811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229109
42NC_016670AAT41194081194201366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229109
43NC_016670TAA41200201200311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229109
44NC_016670CAA41301681301781166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229109
45NC_016670TAT41308171308291333.33 %66.67 %0 %0 %7 %37229109
46NC_016670TAA51320961321111666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229109
47NC_016670GTT4133461133472120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229109
48NC_016670ATT41346911347021233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229109
49NC_016670AAT51347221347351466.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229109
50NC_016670GAA41453721453831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229109
51NC_016670ACC41538661538761133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229108
52NC_016670TTC4154665154675110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229108
53NC_016670ATC41583851583951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_016670ATC41597771597871133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229109
55NC_016670GAA51602471602611566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229109