ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium raimondii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016668ATAGAA3445944761866.67 %16.67 %16.67 %0 %0 %Non-Coding
2NC_016668TATTTT3650865251816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
3NC_016668AAAAAT348263482801883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
4NC_016668ATTTCG353833538491716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
5NC_016668ATATTA358323583391750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
6NC_016668ACAATA364875648921866.67 %16.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
7NC_016668ATTTTT371992720091816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
8NC_016668TTAAAT372016720341950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
9NC_016668GAAGGA397131971481850 %0 %50 %0 %5 %37229098
10NC_016668CTAATT398299983151733.33 %50 %0 %16.67 %5 %37229098
11NC_016668AAGTCA31007811007981850 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %37229098
12NC_016668TTTGTT3102312102330190 %83.33 %16.67 %0 %10 %37229098
13NC_016668TATTAG31043181043341733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229099
14NC_016668TATTAG41043451043672333.33 %50 %16.67 %0 %4 %37229099
15NC_016668ATTAGT31043721043881733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229099
16NC_016668TTAAGT31283161283321733.33 %50 %16.67 %0 %5 %37229099
17NC_016668ACTAAT31444281444441750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37229099
18NC_016668ACTAAT41444481444702350 %33.33 %0 %16.67 %4 %37229099
19NC_016668CTAATA31444821444981750 %33.33 %0 %16.67 %5 %37229099
20NC_016668CTCCTT3151667151684180 %50 %0 %50 %5 %37229098