ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium raimondii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016668ATT5480948231533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_016668GTT449734983110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016668TAA4659966101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016668AAT4661766281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016668TAT4831383251333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_016668TAT5836783801433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016668AGA4870787181266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
8NC_016668AAT413502135131266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_016668TTA417129171401233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016668ATG718176181962133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229092
11NC_016668TAA423892239021166.67 %33.33 %0 %0 %9 %37229092
12NC_016668GTT42432424335120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229092
13NC_016668GAA427775277861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_016668TAT428456284661133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_016668TTA437031370421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_016668ATA438133381451366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_016668ATA538167381821666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
18NC_016668ATA444746447581366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016668ATA448285482971366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_016668AAT448950489601166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016668TAA449468494801366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_016668ATT550190502031433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016668TAT453214532251233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016668CAA453718537281166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_016668GAT461230612411233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %37229094
26NC_016668ATT562433624471533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_016668CTT46551765528120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229094
28NC_016668AAT467454674651266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016668ATA467571675811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_016668TCT46910669118130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016668ATT671453714711933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
32NC_016668ATA572040720531466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016668AAT472057720671166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016668CTT47811278122110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229098
35NC_016668GTT47993479945120 %66.67 %33.33 %0 %8 %37229098
36NC_016668ATA488423884341266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229098
37NC_016668CTT48882588836120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229098
38NC_016668GAT489297893071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229098
39NC_016668GAT490693907031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %37229098
40NC_016668AGA494418944281166.67 %0 %33.33 %0 %9 %37229098
41NC_016668TTC4103706103717120 %66.67 %0 %33.33 %8 %37229099
42NC_016668GAA51143781143921566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229099
43NC_016668AAG41189901190011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229099
44NC_016668AAT41192281192401366.67 %33.33 %0 %0 %7 %37229099
45NC_016668TAA41198401198511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %37229099
46NC_016668CAA41299881299981166.67 %0 %0 %33.33 %9 %37229099
47NC_016668TAA51319001319151666.67 %33.33 %0 %0 %6 %37229099
48NC_016668ATT41344591344701233.33 %66.67 %0 %0 %8 %37229099
49NC_016668GAA41450991451101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %37229099
50NC_016668ACC41535881535981133.33 %0 %0 %66.67 %9 %37229098
51NC_016668TTC4154387154397110 %66.67 %0 %33.33 %9 %37229098
52NC_016668ATC41581131581231133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
53NC_016668ATC41595091595191133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %37229098
54NC_016668GAA51599791599931566.67 %0 %33.33 %0 %6 %37229098