ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Damaster mirabilissimus mirabilissimus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016469	A	12	374	385	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	36428405
2	NC_016469	ATA	4	474	485	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428405
3	NC_016469	AAT	4	527	539	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	36428405
4	NC_016469	ATTAT	4	691	709	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	36428405
5	NC_016469	ATA	4	963	974	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428405
6	NC_016469	TA	6	1056	1067	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	36428405
7	NC_016469	ATTT	3	1103	1114	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	36428405
8	NC_016469	TTAAGC	3	1331	1349	19	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
9	NC_016469	AAT	7	1396	1415	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_016469	AAT	4	1437	1448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016469	TTTAC	3	2255	2268	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	36428405
12	NC_016469	TTTG	3	2523	2533	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	36428405
13	NC_016469	TAATTA	3	3364	3381	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	36428405
14	NC_016469	AAAT	3	3664	3675	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	36428405
15	NC_016469	TTAT	3	4373	4384	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	36428405
16	NC_016469	AATT	3	4409	4421	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	36428405
17	NC_016469	ATT	4	4853	4864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	36428405
18	NC_016469	T	15	5220	5234	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	36428405
19	NC_016469	TAT	5	5827	5841	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	36428405
20	NC_016469	TATAAT	3	6031	6048	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	36428405
21	NC_016469	TTTATA	3	6426	6444	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_016469	ATTTAA	4	6584	6607	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	36428405
23	NC_016469	AAAT	3	6646	6658	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	36428405
24	NC_016469	TTA	4	6661	6671	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	36428405
25	NC_016469	AAAT	3	7174	7184	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	36428405
26	NC_016469	AATA	3	7185	7196	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	36428405
27	NC_016469	TTA	4	7471	7482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428405
28	NC_016469	TAA	5	7580	7594	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	36428405
29	NC_016469	TGAA	3	7661	7671	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	36428405
30	NC_016469	TAA	4	8011	8023	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	36428405
31	NC_016469	TAA	4	8051	8061	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	36428405
32	NC_016469	TAA	5	8282	8295	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	36428405
33	NC_016469	AAATT	3	8311	8326	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	36428405
34	NC_016469	ATA	4	8465	8477	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	36428405
35	NC_016469	ATA	5	8579	8593	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	36428405
36	NC_016469	ATT	4	8827	8838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428405
37	NC_016469	AT	8	9189	9203	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	36428405
38	NC_016469	AAAT	3	9205	9215	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	36428405
39	NC_016469	A	13	9222	9234	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	36428405
40	NC_016469	ATA	4	9255	9266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428405
41	NC_016469	A	15	9393	9407	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	36428405
42	NC_016469	ATA	9	9440	9466	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	36428405
43	NC_016469	TATAAA	3	9627	9644	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	36428405
44	NC_016469	AAT	4	9656	9666	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	36428405
45	NC_016469	CA	6	9820	9831	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	36428406
46	NC_016469	ATAA	4	9877	9892	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	36428406
47	NC_016469	AATA	3	10014	10025	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	36428406
48	NC_016469	AGAA	3	10097	10108	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016469	AAT	4	10258	10269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428406
50	NC_016469	TTTA	3	10351	10362	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	36428406
51	NC_016469	AAT	4	10417	10428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428406
52	NC_016469	TAA	4	10519	10529	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	36428406
53	NC_016469	ATT	4	11041	11051	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	36428406
54	NC_016469	TTA	5	11389	11403	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	36428406
55	NC_016469	TAA	4	11789	11800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428406
56	NC_016469	A	15	12076	12090	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	36428406
57	NC_016469	TAAAT	3	12537	12552	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	36428406
58	NC_016469	AAT	4	12617	12627	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	36428406
59	NC_016469	TAA	4	12810	12821	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428406
60	NC_016469	ATA	4	13895	13906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016469	AATAA	3	13998	14011	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016469	TAAA	3	14105	14115	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016469	ATT	4	14205	14216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016469	AAAT	3	14236	14248	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016469	TTA	4	14448	14459	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016469	CATA	3	14879	14889	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016469	AAAT	3	15084	15096	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016469	TAAA	3	15256	15267	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016469	TAAA	3	15338	15349	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016469	TTA	4	15427	15438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016469	AAT	4	15540	15552	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016469	ATT	4	15642	15653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016469	AAT	10	15675	15705	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016469	AT	6	15704	15715	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016469	T	20	15713	15732	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016469	TA	11	15740	15763	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016469	TTAA	3	15775	15785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016469	TA	7	15815	15830	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016469	TA	7	15836	15849	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016469	AT	7	15881	15893	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016469	TAATTA	3	15959	15975	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_016469	TA	6	16053	16063	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016469	TAA	4	16072	16082	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016469	TAT	5	16115	16129	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016469	AT	7	16138	16150	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016469	AT	12	16386	16408	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016469	AT	8	16419	16434	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016469	TAAT	4	16490	16505	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016469	ATT	4	16504	16515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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