ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Boea hygrometrica chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016468	CTT	4	3649	3659	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016468	ATA	4	3675	3686	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016468	AAT	7	4615	4634	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_016468	AAT	4	15850	15862	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016468	GTT	4	23949	23960	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	36428397
6	NC_016468	ATT	4	29103	29114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016468	GAG	4	35057	35067	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	36428398
8	NC_016468	TTC	4	35787	35798	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	36428398
9	NC_016468	ATG	4	39232	39242	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	36428398
10	NC_016468	GCA	4	41128	41138	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	36428398
11	NC_016468	TGA	4	42628	42638	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016468	TAA	5	42701	42714	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016468	AGA	4	43492	43502	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	36428398
14	NC_016468	ATT	4	47258	47269	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016468	GAT	4	49824	49835	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	36428398
16	NC_016468	TTA	4	52407	52418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016468	TAA	4	55968	55978	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016468	ATT	4	59763	59773	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016468	TAA	4	61962	61973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016468	ATT	4	65540	65552	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016468	TCT	4	74648	74659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	36428400
22	NC_016468	AAC	4	80825	80835	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	36428400
23	NC_016468	CTT	4	84841	84852	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	36428400
24	NC_016468	GAT	4	85309	85319	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	36428400
25	NC_016468	GAT	4	86693	86703	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	36428400
26	NC_016468	CAA	4	89029	89039	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	36428400
27	NC_016468	GAT	4	89726	89737	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	36428400
28	NC_016468	TGA	4	91426	91437	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	36428400
29	NC_016468	AGA	4	110144	110154	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	36428403
30	NC_016468	CAA	4	110735	110746	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	36428403
31	NC_016468	TAA	4	111258	111269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428403
32	NC_016468	TTC	5	119663	119677	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	36428404
33	NC_016468	TAA	4	120067	120078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	36428404
34	NC_016468	TAT	4	124635	124646	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428404
35	NC_016468	TTA	4	126911	126922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428404
36	NC_016468	GAA	4	138947	138958	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016468	ATC	4	148452	148463	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	36428404
38	NC_016468	TTG	4	149150	149160	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	36428404
39	NC_016468	ATC	4	151486	151496	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016468	ATC	4	152870	152880	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	36428404
41	NC_016468	GAA	5	153336	153350	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	36428404

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Boea hygrometrica chloroplast