ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Clava multicornis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016465	ATA	5	1048	1062	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	36428391
2	NC_016465	TAA	5	1301	1315	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	36428391
3	NC_016465	TAAT	3	2113	2123	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016465	TTTTA	3	2719	2733	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016465	TATT	3	2883	2893	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016465	TTTTA	3	2972	2986	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016465	ATTT	3	3080	3091	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016465	TATT	4	3313	3328	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016465	ATT	4	3469	3480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016465	TAA	4	5179	5190	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428392
11	NC_016465	TAT	4	5417	5428	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
12	NC_016465	TTTA	3	5567	5578	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	36428392
13	NC_016465	AATT	3	6227	6238	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	36428392
14	NC_016465	ATT	4	6251	6261	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	36428392
15	NC_016465	TAA	4	6383	6394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428392
16	NC_016465	ATT	4	6612	6623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
17	NC_016465	TTTA	3	6738	6748	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	36428392
18	NC_016465	AT	6	7057	7067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	36428392
19	NC_016465	AT	7	7447	7460	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	36428392
20	NC_016465	ATT	4	7628	7639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
21	NC_016465	ATT	4	8171	8182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
22	NC_016465	TAT	4	8347	8358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
23	NC_016465	ATT	4	8543	8554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
24	NC_016465	GAAA	3	9530	9541	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016465	AATTTA	4	9992	10016	25	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
26	NC_016465	TTA	4	10324	10335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
27	NC_016465	ATA	4	10459	10470	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428392
28	NC_016465	TAT	4	10748	10759	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
29	NC_016465	ATT	4	11551	11562	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	36428392
30	NC_016465	AGC	4	11935	11945	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	36428392
31	NC_016465	T	14	12302	12315	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	36428392
32	NC_016465	TTA	4	12498	12510	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	36428392
33	NC_016465	TTTA	3	12740	12750	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	36428392
34	NC_016465	TTA	4	13315	13326	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428392
35	NC_016465	AAT	4	14528	14539	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36428393
36	NC_016465	TTTA	3	15041	15051	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	36428393
37	NC_016465	TAT	4	15453	15464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	36428393
38	NC_016465	TAT	5	15702	15716	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	36428393
39	NC_016465	GGA	4	15794	15804	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	36428393
40	NC_016465	AGTA	3	16498	16508	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	36428393
41	NC_016465	CTGA	3	16753	16764	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Clava multicornis mitochondrion