ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Dugesia japonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016439	CTTT	3	580	590	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	35984331
2	NC_016439	TTCT	3	718	729	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35984331
3	NC_016439	T	17	972	988	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35984331
4	NC_016439	T	18	1080	1097	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35984331
5	NC_016439	TTTTGT	3	1285	1302	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_016439	ATTT	5	1436	1456	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35984331
7	NC_016439	ATTT	5	1488	1507	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	35984331
8	NC_016439	TTA	4	1548	1558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35984331
9	NC_016439	TGTT	5	1572	1592	21	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35984331
10	NC_016439	TGTTT	3	1638	1651	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	35984331
11	NC_016439	TTGC	3	1882	1892	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	35984331
12	NC_016439	TCT	4	2332	2342	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35984331
13	NC_016439	ATTT	3	2358	2369	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35984331
14	NC_016439	GTTTTT	4	2425	2447	23	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	35984331
15	NC_016439	GTTTT	3	2745	2758	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016439	GGA	5	2984	2998	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016439	T	14	3227	3240	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35984331
18	NC_016439	TGTT	3	3375	3385	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35984331
19	NC_016439	GTG	4	3692	3703	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	35984331
20	NC_016439	ATTG	3	4052	4062	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35984331
21	NC_016439	T	15	4430	4444	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35984331
22	NC_016439	TTTTCT	3	4631	4647	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
23	NC_016439	GTTTG	4	4739	4758	20	0 %	60 %	40 %	0 %	10 %	35984332
24	NC_016439	TTTTTC	3	4849	4867	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	35984332
25	NC_016439	TTTTGT	3	4881	4898	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35984332
26	NC_016439	ATT	4	4996	5006	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35984332
27	NC_016439	GTTT	3	5216	5227	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35984332
28	NC_016439	TTGT	3	5444	5455	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35984332
29	NC_016439	TTTGG	3	5530	5543	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	35984332
30	NC_016439	TTAT	3	5549	5560	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35984332
31	NC_016439	TGGT	3	5985	5995	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	35984332
32	NC_016439	TGTTTT	3	6165	6182	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35984332
33	NC_016439	ATTT	3	6335	6345	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35984332
34	NC_016439	TTTA	4	6551	6565	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35984332
35	NC_016439	T	15	6686	6700	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016439	T	17	6999	7015	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35984332
37	NC_016439	T	17	7019	7035	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35984332
38	NC_016439	TTG	4	7667	7678	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35984332
39	NC_016439	TTAT	3	7684	7695	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35984332
40	NC_016439	T	17	7980	7996	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35984332
41	NC_016439	GTT	5	8207	8220	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	35984332
42	NC_016439	ATTT	3	8451	8461	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35984332
43	NC_016439	TGT	4	8522	8534	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	35984332
44	NC_016439	GTA	4	8548	8558	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016439	ATT	4	8804	8815	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35984332
46	NC_016439	TCT	4	8878	8889	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35984332
47	NC_016439	TTTTA	3	9115	9129	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	35984332
48	NC_016439	TTTG	3	9256	9267	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35984332
49	NC_016439	TTTG	3	9351	9361	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35984332
50	NC_016439	T	13	9697	9709	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35984332
51	NC_016439	TTAG	3	10726	10737	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016439	TTC	4	10805	10816	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35984332
53	NC_016439	TTTG	3	10973	10983	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35984332
54	NC_016439	TTTG	3	11062	11072	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35984332
55	NC_016439	GTT	4	11088	11099	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35984332
56	NC_016439	TTTG	3	11420	11431	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35984332
57	NC_016439	TTTGTT	3	11645	11662	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35984332
58	NC_016439	T	15	11774	11788	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016439	TAT	4	11792	11803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016439	TTTC	3	11847	11857	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016439	TTTCTT	3	11994	12011	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016439	TGGTT	3	12333	12346	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016439	T	12	12454	12465	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016439	ATT	4	12567	12577	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016439	GTTTT	3	13483	13497	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016439	ATTG	3	13513	13523	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016439	TTTA	3	13532	13542	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016439	AATTTA	3	13837	13854	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016439	TTAA	3	13870	13881	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016439	T	15	14337	14351	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016439	ATT	4	14436	14447	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016439	ATT	4	14644	14655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016439	ATT	4	14852	14863	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016439	ATT	4	15060	15071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016439	ATT	4	15268	15279	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016439	ATT	4	15476	15487	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016439	ATT	4	15684	15695	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016439	AT	12	15866	15887	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016439	AT	7	15917	15929	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016439	TA	12	15931	15954	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016439	AT	7	15988	16000	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016439	TA	12	16002	16023	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016439	AT	20	16034	16071	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016439	AT	6	16083	16093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016439	AT	6	16123	16133	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016439	AT	6	16163	16173	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016439	AT	7	16203	16215	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016439	TA	12	16217	16238	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016439	AT	20	16249	16286	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016439	AT	6	16298	16308	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016439	AT	6	16338	16348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016439	AT	6	16378	16388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016439	AT	7	16418	16430	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016439	TA	12	16432	16453	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016439	TA	22	16458	16498	41	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016439	AT	8	16551	16567	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016439	TA	15	16559	16589	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016439	TA	20	16596	16633	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016439	AT	6	16646	16656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016439	AT	7	16687	16702	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016439	TA	12	16700	16721	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016439	AT	18	16732	16765	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016439	AT	6	16777	16787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016439	AT	7	16817	16829	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016439	TA	12	16831	16852	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016439	AT	23	16859	16902	44	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016439	AT	6	16914	16924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016439	AT	6	16954	16964	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016439	AT	6	16994	17004	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016439	AT	6	17034	17044	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016439	AT	7	17074	17086	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016439	TA	12	17088	17109	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016439	AT	11	17120	17142	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016439	AT	7	17176	17188	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016439	TTA	4	17189	17201	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016439	TA	12	17268	17292	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016439	TAT	4	17294	17304	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016439	AT	22	17378	17420	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016439	TA	7	17500	17512	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016439	TTTA	3	17772	17783	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Dugesia japonica mitochondrion