ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Sesamum indicum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016433CATTT41912091920 %60 %0 %20 %10 %Non-Coding
2NC_016433ATTTG3662866421520 %60 %20 %0 %6 %Non-Coding
3NC_016433TTTCT31277312787150 %80 %0 %20 %6 %35942224
4NC_016433TGTTT31699317007150 %80 %20 %0 %6 %37875847
5NC_016433TGTCG31991119926160 %40 %40 %20 %6 %37875847
6NC_016433ATCAA328315283291560 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
7NC_016433AAATA331960319741580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016433CTAAA446926469462160 %20 %0 %20 %9 %Non-Coding
9NC_016433AAGAA347683476971580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
10NC_016433GATAA357676576891460 %20 %20 %0 %7 %35942226
11NC_016433TTTTG38521885232150 %80 %20 %0 %6 %35942224
12NC_016433ATGAT391957919721640 %40 %20 %0 %6 %35942224
13NC_016433TCCGG39484094854150 %20 %40 %40 %6 %35942224
14NC_016433TTTCG39739997412140 %60 %20 %20 %7 %35942224
15NC_016433GATCC399054990691620 %20 %20 %40 %6 %35942228
16NC_016433AAATC31139301139431460 %20 %0 %20 %7 %35942228
17NC_016433AGAAA31213071213201480 %0 %20 %0 %7 %35942228
18NC_016433GGATC31394261394411620 %20 %40 %20 %6 %35942228
19NC_016433CATAC31446101446231440 %20 %0 %40 %7 %35942232
20NC_016433ACAAA31532621532761580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding