ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Sesamum indicum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016433	TAA	4	8001	8012	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016433	TTA	5	9017	9030	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016433	CAA	4	9058	9069	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016433	ATT	4	21522	21533	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942225
5	NC_016433	TAT	5	23019	23032	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942225
6	NC_016433	TCT	5	28531	28544	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016433	TTA	4	32140	32150	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016433	CAA	4	32290	32300	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016433	TTC	4	35684	35695	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	35942225
10	NC_016433	TAA	4	36837	36847	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016433	ATG	4	39222	39232	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35942226
12	NC_016433	GCA	4	41120	41131	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35942226
13	NC_016433	GTA	4	45204	45214	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016433	TAT	4	47034	47046	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016433	AGA	4	51888	51899	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016433	TTA	4	52508	52519	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016433	ATA	5	55471	55486	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942226
18	NC_016433	ATT	4	59855	59865	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016433	TAA	4	60426	60438	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016433	ATT	4	65618	65630	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016433	ATA	4	68034	68045	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016433	TCT	4	75015	75026	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35942224
23	NC_016433	TAT	4	76730	76740	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942224
24	NC_016433	CTT	4	85317	85328	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35942224
25	NC_016433	GAT	4	85785	85795	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35942224
26	NC_016433	GAT	4	87162	87172	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35942224
27	NC_016433	GAT	4	89607	89618	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35942224
28	NC_016433	TGA	4	91310	91321	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35942224
29	NC_016433	TTC	4	99175	99186	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35942228
30	NC_016433	TTA	4	110346	110358	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942228
31	NC_016433	TTA	4	110365	110377	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942228
32	NC_016433	ATT	4	111141	111153	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942228
33	NC_016433	TAA	4	111564	111575	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942228
34	NC_016433	AAG	4	111789	111800	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942228
35	NC_016433	GAA	4	112550	112561	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942228
36	NC_016433	AGA	4	115522	115533	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942228
37	NC_016433	TTC	5	120109	120123	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	35942228
38	NC_016433	TAA	4	121043	121055	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942228
39	NC_016433	TTC	4	126887	126897	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35942228
40	NC_016433	GAA	4	139309	139320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942228
41	NC_016433	ATC	4	148877	148888	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942232
42	NC_016433	ATC	4	151323	151333	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016433	ATC	4	152700	152710	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35942232
44	NC_016433	GAA	5	153166	153180	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	35942232

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Sesamum indicum chloroplast