ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Alloeorhynchus bakeri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016432	TGAATA	3	274	291	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35942222
2	NC_016432	ATA	4	425	435	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942222
3	NC_016432	AAT	4	447	458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942222
4	NC_016432	TAT	4	1043	1053	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942222
5	NC_016432	TAT	4	1137	1148	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942222
6	NC_016432	TTAA	3	1202	1214	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016432	TAT	4	1960	1971	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942222
8	NC_016432	AGG	4	2045	2056	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35942222
9	NC_016432	TA	6	3232	3242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942222
10	NC_016432	ATTT	3	3839	3849	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942222
11	NC_016432	TAT	4	4021	4032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942223
12	NC_016432	GAAG	3	4133	4143	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	35942223
13	NC_016432	AAT	4	4525	4536	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942223
14	NC_016432	ATT	4	4761	4772	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942223
15	NC_016432	CTT	4	5738	5750	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35942223
16	NC_016432	ATT	4	6694	6704	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942223
17	NC_016432	AAT	4	6788	6799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942223
18	NC_016432	AT	6	7398	7408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942223
19	NC_016432	ATA	4	7847	7857	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942223
20	NC_016432	TAAA	3	7993	8005	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35942223
21	NC_016432	AAG	4	8058	8069	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942223
22	NC_016432	ACTA	3	8443	8453	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	35942223
23	NC_016432	AT	7	8756	8769	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35942223
24	NC_016432	ATATTA	4	9204	9227	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942223
25	NC_016432	ATA	4	9242	9254	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942223
26	NC_016432	ATA	4	9403	9413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942223
27	NC_016432	ATA	4	9428	9440	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942223
28	NC_016432	TA	6	9439	9450	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942223
29	NC_016432	ATA	4	9545	9555	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942223
30	NC_016432	TTTA	3	10491	10502	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942223
31	NC_016432	TTAT	3	11291	11301	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942223
32	NC_016432	ATA	4	11662	11673	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942223
33	NC_016432	ATAA	3	11687	11698	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35942223
34	NC_016432	ATA	4	12008	12018	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942223
35	NC_016432	TAA	4	12336	12347	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942223
36	NC_016432	AAT	4	12426	12437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016432	AAAT	3	12732	12742	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016432	TAA	5	13259	13273	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016432	TAGA	3	13276	13287	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016432	AAAT	3	13337	13348	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016432	AATT	5	13484	13504	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016432	AAAT	3	13579	13590	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016432	TTAA	3	13691	13702	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016432	ATT	4	14150	14160	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016432	AT	6	14222	14232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016432	TAAT	4	14386	14401	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016432	CTCC	3	14578	14588	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016432	ATTC	3	14959	14971	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016432	TTTCCT	3	14980	14997	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Alloeorhynchus bakeri mitochondrion