ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Eleutherococcus senticosus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016430	CATT	3	125	135	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016430	TTTTTA	3	204	222	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
3	NC_016430	CAG	4	1072	1083	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	35942212
4	NC_016430	GAA	4	2982	2993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35942212
5	NC_016430	TAAA	3	3906	3916	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016430	CATT	3	4070	4081	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016430	GAAA	3	4151	4162	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016430	AAT	8	4348	4371	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016430	AAAT	3	4441	4451	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016430	A	12	4454	4465	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016430	GAA	4	4874	4885	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016430	GATA	3	5074	5085	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016430	TCTCT	3	5372	5385	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	35942212
14	NC_016430	C	12	5457	5468	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	35942212
15	NC_016430	A	19	5616	5634	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	35942212
16	NC_016430	A	16	6552	6567	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016430	TAACA	3	6595	6608	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016430	GAAT	3	6610	6621	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016430	AAT	4	7152	7163	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016430	CTAA	3	7818	7829	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016430	TTCAG	3	7982	7995	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016430	A	14	9660	9673	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016430	CAA	4	9825	9836	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016430	GTTA	4	10050	10065	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016430	AATT	3	11024	11034	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016430	CAAA	4	11109	11123	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016430	GTAA	3	11469	11480	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	35942212
28	NC_016430	A	14	12884	12897	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016430	AAAATA	3	13492	13508	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	35942212
30	NC_016430	T	12	13596	13607	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35942212
31	NC_016430	A	16	14218	14233	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016430	ATTT	3	15497	15507	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016430	TTTA	4	15591	15606	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016430	ACT	4	16080	16091	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942213
35	NC_016430	A	13	17663	17675	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016430	T	13	19876	19888	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35942213
37	NC_016430	AT	6	21242	21252	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942213
38	NC_016430	AT	6	22269	22282	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35942213
39	NC_016430	A	15	23935	23949	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35942213
40	NC_016430	AAAG	3	24323	24333	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	35942213
41	NC_016430	GTT	4	24964	24975	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35942213
42	NC_016430	CCTA	3	25885	25895	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	35942213
43	NC_016430	T	12	27585	27596	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35942213
44	NC_016430	TCAT	3	28269	28279	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016430	ATCAA	3	29362	29376	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016430	AT	14	29876	29901	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016430	TA	9	29895	29911	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016430	TA	6	29915	29926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016430	TCAA	3	30673	30684	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016430	AAGA	3	31042	31057	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016430	TCTT	3	31064	31075	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016430	AATT	3	31208	31219	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016430	TTTA	3	31223	31233	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942213
54	NC_016430	ATTCAT	3	33024	33042	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
55	NC_016430	TTCTA	4	33120	33139	20	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016430	AAAAT	3	33176	33190	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016430	TA	7	33615	33628	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016430	ATGA	3	33962	33972	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016430	A	13	34056	34068	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016430	TTATT	3	34508	34521	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016430	GAAA	3	36631	36642	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35942214
62	NC_016430	GAG	4	36751	36761	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35942214
63	NC_016430	TTC	4	37481	37492	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35942214
64	NC_016430	AG	6	37813	37823	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016430	TA	6	38021	38032	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016430	TGTA	3	38178	38188	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016430	TC	6	38429	38439	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35942214
68	NC_016430	CTT	4	38574	38585	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016430	TA	6	38678	38688	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016430	GATC	3	39157	39167	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016430	ATG	4	40994	41004	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35942214
72	NC_016430	TG	6	42929	42939	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	35942214
73	NC_016430	AAAG	3	43279	43290	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35942214
74	NC_016430	AAAT	3	44758	44769	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016430	A	14	46970	46983	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016430	ATTT	3	47567	47578	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016430	ATTT	3	48035	48045	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016430	CTAAA	4	48730	48750	21	60 %	20 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016430	TA	6	49279	49289	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016430	CATA	3	51011	51021	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016430	TTA	4	54038	54049	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016430	ATT	4	55308	55320	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942215
83	NC_016430	ATA	5	57015	57030	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942215
84	NC_016430	TA	6	57313	57323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016430	A	14	57572	57585	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016430	TTG	4	57767	57777	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016430	AT	6	59337	59348	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016430	ACTT	3	59571	59581	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016430	TAG	4	59668	59678	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016430	ATTT	3	61438	61449	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016430	TTC	4	61626	61636	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016430	AAAAT	3	61648	61662	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016430	ATA	5	61879	61892	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016430	AT	6	61908	61918	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016430	TAA	4	62031	62042	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016430	AT	6	64521	64531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942215
97	NC_016430	AAATA	3	64877	64890	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35942215
98	NC_016430	AT	6	66133	66143	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016430	TAAA	3	68038	68048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016430	AT	7	69516	69528	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016430	TCT	4	70070	70081	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016430	TA	7	70390	70402	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016430	TATT	3	70431	70442	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016430	TAA	4	70738	70749	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942216
105	NC_016430	TGAA	3	71478	71489	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016430	TTTC	3	71512	71524	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016430	TTTC	3	71634	71644	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016430	TATTC	3	72164	72178	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016430	AAGA	5	72809	72827	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	35942213
110	NC_016430	TTTA	3	73031	73042	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942213
111	NC_016430	T	16	73115	73130	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35942213
112	NC_016430	A	13	73278	73290	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35942213
113	NC_016430	CATAGT	3	74901	74917	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	35942213
114	NC_016430	CTTT	3	74948	74959	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35942213
115	NC_016430	GGTT	3	75988	75999	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	35942213
116	NC_016430	CAAA	3	76667	76677	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	35942213
117	NC_016430	GTCT	3	77522	77532	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	35942213
118	NC_016430	AT	8	79702	79716	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35942213
119	NC_016430	T	17	80707	80723	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35942213
120	NC_016430	TCT	4	80799	80810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35942213
121	NC_016430	TTAT	3	83164	83175	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942213
122	NC_016430	T	13	83750	83762	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35942213
123	NC_016430	TATT	3	84747	84758	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942213
124	NC_016430	AT	6	85006	85016	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942213
125	NC_016430	AGAATT	3	85203	85221	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	35942213
126	NC_016430	ACTA	3	86205	86215	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	35942213
127	NC_016430	TA	10	86477	86498	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942213
128	NC_016430	GAT	4	88755	88765	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35942213
129	NC_016430	GAAA	3	89982	89994	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	35942213
130	NC_016430	CTTT	3	91030	91040	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	35942213
131	NC_016430	TGA	4	92969	92980	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35942213
132	NC_016430	AATA	3	93828	93840	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35942213
133	NC_016430	GAAGGA	3	94614	94631	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	35942213
134	NC_016430	TCCGG	3	96496	96510	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	35942213
135	NC_016430	TTTCG	3	99085	99098	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	35942213
136	NC_016430	TTTGTT	3	99477	99495	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	35942213
137	NC_016430	ATTAGT	3	101429	101445	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	35942216
138	NC_016430	ATCC	3	104705	104716	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	35942216
139	NC_016430	TCTA	3	105097	105108	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35942216
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Eleutherococcus senticosus chloroplast