ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Apodemus agrarius mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016428AAACT49239411960 %20 %0 %20 %5 %Non-Coding
2NC_016428TAA4111411241166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016428TAAAA3188218951480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_016428GTTC324642475120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
5NC_016428TTA4275827681133.33 %66.67 %0 %0 %9 %35942209
6NC_016428CAT4391839291233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %35942209
7NC_016428CAA4416241741366.67 %0 %0 %33.33 %7 %35942209
8NC_016428TCC446434653110 %33.33 %0 %66.67 %9 %35942209
9NC_016428TAT4581758281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %35942209
10NC_016428TTAC3608960991125 %50 %0 %25 %9 %35942209
11NC_016428ACTC3639564051125 %25 %0 %50 %9 %35942209
12NC_016428TA6725072601150 %50 %0 %0 %9 %35942209
13NC_016428CAT4778777971133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %35942209
14NC_016428TTA410347103571133.33 %66.67 %0 %0 %9 %35942210
15NC_016428ATT410540105521333.33 %66.67 %0 %0 %7 %35942210
16NC_016428ACTA310693107031150 %25 %0 %25 %9 %35942210
17NC_016428CTTT31165111662120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
18NC_016428TTA512089121031533.33 %66.67 %0 %0 %6 %35942210
19NC_016428AAT412341123521266.67 %33.33 %0 %0 %0 %35942210
20NC_016428TAG412480124911233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %35942210
21NC_016428AACT313449134591150 %25 %0 %25 %9 %35942210
22NC_016428AAT513554135681566.67 %33.33 %0 %0 %6 %35942210
23NC_016428ATCA313681136921250 %25 %0 %25 %0 %35942210
24NC_016428TACA315426154371250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
25NC_016428TA615438154491250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016428TCTA315662156731225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
27NC_016428AACC315687156971150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
28NC_016428TATT315894159051225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding