ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Semirossia patagonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016425	ATT	4	1594	1604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942205
2	NC_016425	TAA	6	1682	1698	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35942205
3	NC_016425	AAT	5	1976	1990	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942205
4	NC_016425	ATT	4	2124	2135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942205
5	NC_016425	AAT	4	2294	2305	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
6	NC_016425	GAG	4	3080	3091	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	35942205
7	NC_016425	ATA	4	4629	4639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942205
8	NC_016425	AAT	4	4804	4815	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
9	NC_016425	ATA	4	5413	5423	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942205
10	NC_016425	TAA	4	5751	5762	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
11	NC_016425	TAA	4	6208	6220	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942206
12	NC_016425	ATT	4	6229	6241	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942206
13	NC_016425	TAT	4	6338	6348	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942206
14	NC_016425	ATT	4	6566	6577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
15	NC_016425	ATA	7	8239	8259	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942206
16	NC_016425	TAT	4	8481	8492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
17	NC_016425	TAA	4	9128	9139	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942206
18	NC_016425	TAA	4	9369	9380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35942206
19	NC_016425	CAA	4	9502	9513	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35942206
20	NC_016425	TTA	6	10166	10184	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_016425	TAT	4	11945	11956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016425	AAT	4	12069	12079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016425	ATA	4	12262	12274	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016425	TAT	4	12285	12296	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016425	ATA	4	12298	12309	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016425	TAT	4	12518	12529	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016425	TAT	4	13479	13490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
28	NC_016425	TAA	4	14417	14427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016425	TTA	4	14634	14645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016425	TTA	4	14950	14961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
31	NC_016425	ATC	4	15269	15280	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942206
32	NC_016425	TAA	5	15429	15442	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016425	TAA	4	15484	15494	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016425	TAA	4	15667	15679	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016425	ATA	4	16053	16064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016425	TAT	4	16351	16361	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016425	TAT	4	17068	17080	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Semirossia patagonica mitochondrion