ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Semirossia patagonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016425	ATTT	3	1435	1445	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942205
2	NC_016425	ATT	4	1594	1604	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942205
3	NC_016425	TAA	6	1682	1698	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35942205
4	NC_016425	AAT	5	1976	1990	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942205
5	NC_016425	TTTAT	3	2012	2026	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	35942205
6	NC_016425	ATT	4	2124	2135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942205
7	NC_016425	AATT	4	2188	2204	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35942205
8	NC_016425	AAT	4	2294	2305	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
9	NC_016425	TTTA	3	2385	2395	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942205
10	NC_016425	CTTC	3	2725	2735	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35942205
11	NC_016425	GAG	4	3080	3091	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	35942205
12	NC_016425	TATT	3	3809	3819	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942205
13	NC_016425	TA	6	4070	4081	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942205
14	NC_016425	ATA	4	4629	4639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942205
15	NC_016425	AAT	4	4804	4815	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
16	NC_016425	TAAA	3	4989	4999	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942205
17	NC_016425	AAAT	3	5289	5299	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942205
18	NC_016425	ATA	4	5413	5423	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942205
19	NC_016425	TAA	4	5751	5762	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942205
20	NC_016425	A	13	5844	5856	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35942205
21	NC_016425	TAA	4	6208	6220	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942206
22	NC_016425	ATT	4	6229	6241	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942206
23	NC_016425	TAT	4	6338	6348	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942206
24	NC_016425	ATT	4	6566	6577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
25	NC_016425	TAAA	5	6698	6718	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942206
26	NC_016425	AT	13	8001	8025	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016425	ATA	7	8239	8259	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942206
28	NC_016425	TA	6	8266	8277	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942206
29	NC_016425	TAT	4	8481	8492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
30	NC_016425	A	12	8674	8685	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35942206
31	NC_016425	TA	6	8915	8925	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942206
32	NC_016425	TAAT	3	8928	8940	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35942206
33	NC_016425	TA	6	8979	8989	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942206
34	NC_016425	TAA	4	9128	9139	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942206
35	NC_016425	TTTA	3	9156	9166	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942206
36	NC_016425	TAA	4	9369	9380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35942206
37	NC_016425	CAA	4	9502	9513	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35942206
38	NC_016425	ATTT	4	9800	9815	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016425	TATTT	3	9971	9985	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016425	TTA	6	10166	10184	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_016425	AT	10	11334	11352	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016425	ATAA	3	11400	11411	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016425	TAT	4	11945	11956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016425	AAT	4	12069	12079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016425	TA	6	12163	12174	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016425	ATA	4	12262	12274	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016425	TAT	4	12285	12296	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016425	ATA	4	12298	12309	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016425	TAT	4	12518	12529	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016425	AT	6	12868	12878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942206
51	NC_016425	TAT	4	13479	13490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
52	NC_016425	AATT	3	13784	13795	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942206
53	NC_016425	TAA	4	14417	14427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016425	TTA	4	14634	14645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016425	GATA	3	14714	14724	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	35942206
56	NC_016425	TTA	4	14950	14961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942206
57	NC_016425	ATC	4	15269	15280	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942206
58	NC_016425	TAA	5	15429	15442	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016425	TAA	4	15484	15494	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016425	TATT	3	15607	15617	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016425	TAA	4	15667	15679	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016425	AAAT	3	15713	15723	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016425	ATA	4	16053	16064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016425	ATTA	3	16106	16116	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016425	TAT	4	16351	16361	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016425	AAAT	3	16765	16776	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016425	TAAA	3	16998	17009	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016425	TAT	4	17068	17080	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Semirossia patagonica mitochondrion