ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bathyteuthis abyssicola mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016423	TAGGTA	3	224	241	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	35942202
2	NC_016423	TTTG	3	266	277	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35942202
3	NC_016423	TAATT	3	778	792	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	35942202
4	NC_016423	TTAT	3	1031	1042	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942202
5	NC_016423	CTTC	3	1719	1729	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35942202
6	NC_016423	CTA	4	1986	1997	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942202
7	NC_016423	GAG	4	2074	2085	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	35942202
8	NC_016423	ATA	4	3651	3661	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016423	TTCA	3	3957	3968	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35942202
10	NC_016423	TAA	4	4444	4455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942202
11	NC_016423	TTA	4	4885	4896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942202
12	NC_016423	CTA	4	4993	5004	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942202
13	NC_016423	TAT	4	5426	5437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942202
14	NC_016423	ATA	4	6415	6427	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942202
15	NC_016423	TA	8	6562	6577	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35942202
16	NC_016423	AAT	4	6582	6592	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942202
17	NC_016423	ATA	4	6936	6947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942202
18	NC_016423	TTAA	3	7225	7237	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35942202
19	NC_016423	TA	7	7277	7289	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35942202
20	NC_016423	TTA	4	7618	7629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35942202
21	NC_016423	TAA	4	7667	7678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35942202
22	NC_016423	TAAA	3	7690	7700	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942202
23	NC_016423	ATAA	3	8159	8170	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35942203
24	NC_016423	AACAA	3	8266	8280	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	35942203
25	NC_016423	TAA	8	8553	8575	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942203
26	NC_016423	ATA	4	8906	8917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942203
27	NC_016423	A	13	8997	9009	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35942203
28	NC_016423	TAA	4	9363	9375	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942203
29	NC_016423	TAT	4	9493	9503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942203
30	NC_016423	TAAA	4	9855	9870	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	35942203
31	NC_016423	ATA	4	10467	10477	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942203
32	NC_016423	TAAC	3	10771	10783	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	35942203
33	NC_016423	ATA	5	11310	11324	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016423	AATTT	3	12183	12197	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016423	TTAA	4	12823	12837	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016423	TAT	4	12838	12850	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016423	TTA	4	12911	12921	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016423	AT	16	12921	12952	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016423	ATTT	3	14067	14077	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942203
40	NC_016423	ATT	4	14420	14430	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942203
41	NC_016423	ATT	7	14492	14512	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942203
42	NC_016423	ATT	4	14756	14767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942203
43	NC_016423	TAA	4	14925	14936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942203
44	NC_016423	CTTC	3	15357	15367	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35942203
45	NC_016423	CTA	4	15624	15635	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942203
46	NC_016423	GAG	4	15712	15723	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	35942203
47	NC_016423	ATA	4	17289	17299	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016423	TTCA	3	17595	17606	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	35942203
49	NC_016423	TAA	4	18082	18093	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942203
50	NC_016423	TA	6	18490	18500	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016423	TAAA	3	18833	18843	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016423	TA	6	19008	19019	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016423	ATT	4	19166	19178	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016423	TTAA	4	19757	19771	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016423	TAT	4	19772	19784	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016423	TTA	4	19845	19855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016423	AT	16	19855	19886	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Bathyteuthis abyssicola mitochondrion