ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Fabriciana nerippe mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016419	TTTAT	3	125	139	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016419	TTAATT	3	234	252	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	35942196
3	NC_016419	ATTT	3	464	474	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942196
4	NC_016419	TAT	4	531	542	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942196
5	NC_016419	AATT	3	786	796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942196
6	NC_016419	ATTT	3	865	876	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942196
7	NC_016419	TTTAAT	3	928	945	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35942196
8	NC_016419	ATTA	4	1026	1040	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35942196
9	NC_016419	TTTA	3	1101	1112	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942196
10	NC_016419	ATTTT	3	1441	1454	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35942196
11	NC_016419	TATAA	3	1734	1747	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35942196
12	NC_016419	AGG	4	2115	2126	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35942196
13	NC_016419	GAAA	3	2234	2245	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35942196
14	NC_016419	ATTT	4	2475	2490	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35942196
15	NC_016419	ATT	7	2842	2862	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942196
16	NC_016419	ATT	4	2887	2897	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942196
17	NC_016419	TTTA	3	3299	3311	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	35942196
18	NC_016419	AATT	3	3716	3726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35942196
19	NC_016419	ATT	4	3946	3956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942196
20	NC_016419	T	16	4251	4266	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35942196
21	NC_016419	T	15	4973	4987	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35942197
22	NC_016419	TAT	8	5571	5595	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
23	NC_016419	ATTT	3	5808	5819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35942197
24	NC_016419	TAAT	3	5906	5917	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942197
25	NC_016419	ATA	4	6324	6335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35942197
26	NC_016419	TAAA	3	6358	6369	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35942197
27	NC_016419	TAT	4	6665	6676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
28	NC_016419	AAAT	3	6904	6915	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35942197
29	NC_016419	TTA	4	7183	7194	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
30	NC_016419	AAT	5	7472	7487	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942197
31	NC_016419	TAAA	3	7526	7536	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942197
32	NC_016419	TAA	4	7726	7738	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942197
33	NC_016419	TAAA	3	7766	7777	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35942197
34	NC_016419	ATAAA	3	7992	8006	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35942197
35	NC_016419	ATC	4	8413	8424	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35942197
36	NC_016419	A	15	9107	9121	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35942197
37	NC_016419	AATAA	4	9168	9187	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	35942197
38	NC_016419	TATAAA	3	9362	9379	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35942197
39	NC_016419	TAT	4	9428	9439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35942197
40	NC_016419	TAAAT	3	9458	9472	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	35942197
41	NC_016419	AT	7	9570	9584	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35942197
42	NC_016419	ATT	4	9586	9598	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35942197
43	NC_016419	AAT	4	9707	9717	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35942197
44	NC_016419	ATT	5	9845	9859	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016419	ATT	4	10156	10167	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
46	NC_016419	TTA	4	10240	10251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
47	NC_016419	TAA	5	10307	10321	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942197
48	NC_016419	ATTT	4	10327	10342	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35942197
49	NC_016419	T	14	10679	10692	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35942197
50	NC_016419	TTA	4	10773	10784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
51	NC_016419	ATTT	3	10960	10970	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35942197
52	NC_016419	TTA	4	11004	11015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35942197
53	NC_016419	GATTT	3	11097	11111	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	35942197
54	NC_016419	ATTTTA	3	11115	11132	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35942197
55	NC_016419	TAT	4	11408	11418	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35942197
56	NC_016419	TAAT	3	11553	11564	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	35942197
57	NC_016419	AAAT	3	11669	11679	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35942197
58	NC_016419	A	12	11768	11779	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35942197
59	NC_016419	ATA	5	11835	11850	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35942197
60	NC_016419	TTAA	3	12067	12078	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35942197
61	NC_016419	AAT	4	12168	12180	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35942197
62	NC_016419	TAAAT	4	12257	12276	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	35942197
63	NC_016419	TATT	3	12668	12679	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016419	TTAA	3	12723	12734	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016419	T	14	12863	12876	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016419	AAT	4	13010	13021	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016419	AT	6	13034	13045	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016419	TATT	3	13402	13413	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016419	TAT	4	13533	13544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016419	ATTT	3	13887	13897	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016419	TAATTT	3	14266	14284	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_016419	AAATT	3	14528	14542	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016419	ATATT	3	14578	14591	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016419	TAATT	3	14607	14621	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016419	ATTA	4	14713	14728	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016419	TAT	5	14813	14826	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016419	T	19	14837	14855	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_016419	AT	12	15010	15032	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016419	AT	12	15047	15068	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Fabriciana nerippe mitochondrion