ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 34

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016401	ATT	4	3343	3353	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016401	AAG	4	6123	6135	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016401	CTG	4	6279	6289	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016401	TAT	5	7027	7042	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016401	AGA	5	9131	9145	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016401	CTT	4	9655	9665	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016401	AGA	4	10178	10189	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016401	CTT	4	12507	12518	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016401	TAC	4	16897	16907	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016401	TCA	4	18368	18378	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016401	TAG	4	23692	23703	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016401	TAT	4	31502	31514	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016401	GCT	4	33165	33176	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016401	AGT	4	38712	38722	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016401	GAA	4	39701	39713	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016401	CTA	4	39841	39852	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016401	ACT	4	41367	41378	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016401	CTT	4	43178	43189	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016401	ATT	4	47264	47275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016401	AAG	4	48691	48702	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016401	CTT	4	49474	49486	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016401	TTA	4	51324	51335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016401	AAT	4	51797	51808	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016401	TAG	4	53556	53567	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016401	GAA	4	53818	53828	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016401	AGA	4	56326	56336	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016401	AGT	4	57932	57943	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016401	ATA	4	58437	58447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016401	AAG	4	59296	59307	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016401	TTA	4	65130	65140	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016401	CAA	4	70486	70496	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016401	CAA	4	70912	70923	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016401	TTC	4	83442	83453	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016401	GAA	4	90440	90450	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016401	AGC	4	91159	91169	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016401	CAA	4	91266	91277	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016401	CCT	4	91388	91399	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016401	AGA	4	97045	97057	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016401	CAT	4	98556	98567	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016401	CTT	4	98623	98634	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016401	CTT	4	99541	99552	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016401	TAT	5	100421	100434	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016401	AGA	4	101224	101234	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 34