ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 54

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016400	CTG	4	86	97	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016400	CAA	4	218	229	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016400	ATT	4	5853	5864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016400	GTA	4	8366	8376	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016400	TTA	4	8830	8841	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016400	AGA	4	9786	9796	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016400	CTT	4	11676	11688	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016400	CTT	4	12129	12140	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016400	ATT	4	12299	12310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016400	TAG	4	12417	12427	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016400	ATG	4	13705	13715	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016400	TAG	4	13924	13934	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016400	CTT	4	19243	19254	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016400	ATA	4	20758	20769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016400	TAA	4	23241	23251	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016400	GTA	4	25616	25627	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016400	ACT	4	26772	26782	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016400	TTC	4	31816	31826	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016400	AAG	4	33378	33389	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016400	CTT	4	33820	33831	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016400	GTG	4	34767	34777	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016400	TCT	4	36246	36257	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016400	CAG	4	37985	37996	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016400	AAG	5	38569	38583	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016400	TGC	4	47092	47103	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016400	AAG	4	55747	55757	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016400	ATT	4	56873	56884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016400	TTA	4	57391	57402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016400	TTA	4	57970	57981	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016400	ATA	4	59035	59046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016400	CTT	5	60263	60276	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016400	ACT	4	60663	60673	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016400	AAG	4	61456	61466	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016400	TCT	4	75561	75572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016400	CAG	4	76747	76758	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016400	AAC	5	77849	77863	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016400	AAG	4	78869	78880	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016400	AAG	4	80757	80768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016400	AAG	4	81175	81186	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016400	TCT	4	84577	84588	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016400	GAA	4	85620	85631	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016400	GCT	4	88510	88521	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016400	AGA	4	89368	89379	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 54