ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 19

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016398	AGA	4	769	779	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016398	GTA	4	1596	1606	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016398	TTAA	3	2083	2095	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016398	ATG	4	2668	2679	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016398	CTTT	3	3280	3292	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016398	TGGG	3	3425	3435	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016398	CTA	4	3884	3894	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016398	AT	6	4895	4906	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016398	CTTTT	3	5879	5893	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016398	AGAATA	3	6092	6110	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_016398	ATTCTT	3	6533	6550	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016398	CAG	4	6671	6682	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016398	ACCT	3	7595	7605	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016398	TGC	4	8224	8235	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016398	GCT	4	8348	8359	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016398	GAAA	3	9658	9669	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016398	ATAG	3	10286	10297	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016398	TGGA	3	11834	11844	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016398	TGA	4	12008	12018	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016398	GCCG	3	15666	15677	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016398	TCTGA	3	15707	15721	15	20 %	40 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016398	TCCA	3	16051	16063	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016398	AAAGT	3	16637	16651	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016398	AAGA	4	16904	16919	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016398	GA	6	16918	16928	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016398	TTTC	3	19079	19089	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016398	TGAT	3	21835	21847	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016398	GTA	4	22054	22064	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016398	AG	6	23212	23222	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016398	GTA	4	24841	24852	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016398	AT	8	26639	26654	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016398	AGC	4	27300	27311	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016398	CTTA	3	27491	27502	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016398	TTA	4	27584	27595	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016398	TCTT	3	28150	28161	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016398	TAT	4	28633	28643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016398	TGA	4	29126	29137	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016398	AGA	5	30280	30294	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016398	TGA	4	30987	30999	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016398	CTT	4	31646	31656	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016398	TTCAG	4	32168	32186	19	20 %	40 %	20 %	20 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016398	GAG	4	32422	32432	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016398	AGTA	3	32577	32587	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016398	AATTT	3	33214	33228	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016398	TTAAC	3	35724	35738	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016398	TTC	4	35770	35782	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016398	GA	6	36698	36708	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016398	AAGG	3	38325	38335	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016398	ATTT	3	39570	39581	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016398	GAA	4	42026	42037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016398	AAAG	4	42710	42724	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016398	GGCT	4	42976	42991	16	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016398	TTAAA	4	44825	44844	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_016398	CAT	4	45953	45963	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016398	TAAT	3	46360	46372	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016398	ATTG	3	47698	47709	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016398	GTCA	3	49155	49165	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016398	AT	7	49597	49609	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016398	GA	6	50353	50363	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016398	CTTT	3	50516	50526	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016398	AGTA	3	51548	51558	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016398	ATTGG	3	54144	54158	15	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016398	CAT	4	54511	54521	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016398	CT	7	55280	55292	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016398	AGA	4	55481	55491	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016398	GAAA	3	55808	55819	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016398	TTAA	3	56181	56192	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016398	GGACT	3	56479	56494	16	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016398	AAAG	3	57030	57041	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016398	TGGAC	3	57495	57508	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016398	CTT	4	58411	58422	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016398	CAA	4	58485	58496	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016398	CTCG	3	59511	59521	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016398	TAAGGT	3	59695	59711	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_016398	AG	6	60179	60189	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016398	TCT	5	62000	62014	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016398	TA	7	62408	62420	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016398	ACTTC	3	63131	63144	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016398	CCCG	3	63385	63396	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016398	TCGC	4	63415	63430	16	0 %	25 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016398	TTAA	3	64175	64187	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016398	AGA	4	65111	65122	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016398	CTA	4	65170	65181	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016398	TCT	4	65430	65441	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016398	AT	6	65573	65584	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016398	AAAGG	3	66274	66288	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016398	TTC	4	66493	66503	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016398	GAAA	3	69812	69822	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016398	CTTT	3	70298	70308	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016398	CAAG	3	70676	70686	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016398	TCT	4	72893	72904	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016398	CTT	4	73223	73233	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016398	TAGA	3	73550	73562	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016398	AAGGT	3	74722	74736	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016398	AATG	3	77392	77402	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016398	CAT	4	78033	78043	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016398	AAAG	3	78715	78725	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016398	AAAG	3	79397	79408	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016398	GAA	4	80598	80608	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016398	CTTT	3	81627	81637	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016398	GCGA	3	82394	82405	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016398	TACAG	3	82517	82530	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016398	TCT	5	82840	82854	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016398	TA	6	83527	83537	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016398	A	14	83986	83999	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016398	CTTTCT	3	84043	84059	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016398	AAATTT	4	86148	86171	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016398	TA	6	86951	86961	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016398	CTT	4	88033	88045	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016398	GAAA	3	88314	88325	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016398	AGA	4	88972	88985	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016398	TAGGG	3	89081	89095	15	20 %	20 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016398	AAGG	3	90430	90440	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016398	AT	6	90991	91001	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016398	CTAG	4	92095	92110	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016398	CAAG	3	94273	94284	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016398	GAT	4	97007	97017	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016398	TCTG	3	97063	97073	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016398	AG	6	97360	97370	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016398	CTTT	3	100746	100756	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016398	CAG	4	100776	100787	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016398	TC	6	101954	101964	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016398	AAT	4	103229	103240	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016398	AG	6	104084	104094	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016398	GTA	5	104352	104366	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016398	AGA	4	105773	105783	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016398	TCT	5	105989	106002	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016398	CT	6	106654	106665	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016398	CTT	4	106668	106679	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016398	TCT	4	106778	106789	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016398	CT	6	109048	109058	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016398	TTTATT	3	110651	110669	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
133	NC_016398	AGGG	3	110960	110971	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016398	CTCA	3	111336	111347	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016398	CAGA	3	112369	112379	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016398	AGG	4	113378	113388	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016398	CTTA	3	113614	113625	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016398	CTT	4	114026	114037	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016398	ATC	4	114257	114268	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016398	TATAGG	3	114795	114812	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016398	AT	7	114865	114878	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016398	TCTCC	3	115026	115039	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016398	TAGC	3	117507	117517	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016398	ATC	5	118000	118014	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016398	AAAG	3	118088	118098	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016398	TA	6	118657	118667	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016398	TC	6	118700	118710	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016398	ACTTTA	3	118846	118862	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
149	NC_016398	TTC	4	119959	119970	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016398	TA	6	121615	121625	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016398	ATC	4	121655	121666	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016398	TA	6	122007	122017	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016398	TTC	5	122698	122712	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
154	NC_016398	AAGC	3	123714	123724	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016398	TTG	4	125037	125047	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016398	GAA	5	125715	125729	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016398	TAG	5	126184	126198	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
158	NC_016398	GAGCAA	3	126423	126440	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
159	NC_016398	CTT	4	126964	126976	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 19