ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 4

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016397TTCG317231734120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
2NC_016397AAAG3562456341175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
3NC_016397AATA3663866501375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_016397AAAG3708570951175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016397AAGT3734673571250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016397ATCC3740574161225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
7NC_016397ATCA3894989611350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
8NC_016397TTCA311344113561325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
9NC_016397AAAG311399114111375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
10NC_016397AAGG312811128211150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016397CTTT31546315474120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016397GAAA319066190771275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016397CTTT32131521326120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
14NC_016397CAAG321815218291550 %0 %25 %25 %6 %Non-Coding
15NC_016397CTTT32189021900110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
16NC_016397ACTC325012250231225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
17NC_016397AAAG327179271891175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016397GAAA327668276781175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
19NC_016397CTTG43086630882170 %50 %25 %25 %5 %Non-Coding
20NC_016397TCTT33135631367120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
21NC_016397AAGA333451334621275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
22NC_016397AAGA334093341041275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
23NC_016397CAAG337673376831150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
24NC_016397TAAA338606386181375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_016397GCAG340457404681225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
26NC_016397AGTT340506405161125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
27NC_016397CAAA343009430191175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
28NC_016397AGAA445426454401575 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
29NC_016397AAGA346278462891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
30NC_016397TTTC34701547027130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
31NC_016397ATTT347051470621225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016397TGTC34742247433120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
33NC_016397ACAG349026490361150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
34NC_016397TTTA349616496271225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_016397TTAT351963519751325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_016397GAAA352127521371175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
37NC_016397TAGG353683536941225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
38NC_016397AGAA354663546741275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
39NC_016397AATG355179551901250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016397CTAT356201562121225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
41NC_016397AAGA356357563681275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
42NC_016397TGGC35655456565120 %25 %50 %25 %8 %Non-Coding
43NC_016397TCTT35732157331110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
44NC_016397TCTT35764557656120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_016397TTTC36279062801120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
46NC_016397AAAG367563675741275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016397CTTT36761067621120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
48NC_016397TTTC36785367865130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
49NC_016397TTAG367878678891225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016397ATCG368111681221225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
51NC_016397TTTC37119571206120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
52NC_016397TCGA372372723831225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
53NC_016397ATCG373809738191125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
54NC_016397GAAA376953769631175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016397AACC377466774771250 %0 %0 %50 %0 %Non-Coding
56NC_016397AAAG377548775591275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
57NC_016397CTTT37757277584130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
58NC_016397CACT380257802671125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
59NC_016397TTGC38120481216130 %50 %25 %25 %7 %Non-Coding
60NC_016397CCTT38349183501110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
61NC_016397CTTT38620886218110 %75 %0 %25 %9 %35805111
62NC_016397AAGA488627886421675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
63NC_016397GAAA389375893861275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016397GAAA395334953441175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
65NC_016397AAGA31027691027791175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016397TTCT3106648106659120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
67NC_016397TTCT3107537107549130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
68NC_016397CATG31080321080441325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
69NC_016397TTAA31107621107731250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
70NC_016397AAGG31114491114601250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
71NC_016397TAGA31115061115161150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
72NC_016397AAAG31158251158351175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
73NC_016397TTCT3116944116955120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
74NC_016397CTTT3116982116993120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
75NC_016397CCTT4118150118165160 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
76NC_016397TTTC3119860119872130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
77NC_016397CGCC3121116121127120 %0 %25 %75 %0 %Non-Coding
78NC_016397AAAG31234321234441375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
79NC_016397TCTT4123564123579160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
80NC_016397AGCC31266421266531225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
81NC_016397GATA31296561296671250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016397TAGT31299231299341225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
83NC_016397AAAG31300301300411275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
84NC_016397CTTT3131734131746130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
85NC_016397TGGG3131757131767110 %25 %75 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016397TTAT31322381322491225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016397TATT41372551372701625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
88NC_016397TTCC3139656139667120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
89NC_016397TCTT3139945139955110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
90NC_016397AGAA31431531431631175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
91NC_016397CCAA31439091439191150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
92NC_016397CTTT3144747144758120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
93NC_016397GCTT3147306147316110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding