ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 2

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016396GAA45505611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
2NC_016396CTT423792389110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_016396TCT531053118140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
4NC_016396TCT443634374120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
5NC_016396GAA4514251531266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016396CGG452135224120 %0 %66.67 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_016396CAT4886688771233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
8NC_016396CTA414285142951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
9NC_016396TTC41517215182110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
10NC_016396TTA415255152661233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016396AGC417462174731233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
12NC_016396TTA420456204671233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
13NC_016396TAG426324263351233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_016396AGA427473274851366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
15NC_016396TTA431793318051333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
16NC_016396CTT53472934744160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
17NC_016396TGT43973039740110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016396GAA440071400821266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
19NC_016396AAG441918419301366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
20NC_016396GAA444813448251366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
21NC_016396GAA444987449991366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
22NC_016396TGA445148451591233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
23NC_016396TAT448879488891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_016396GTA449145491561233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016396TAT450132501431233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
26NC_016396CAG554736547511633.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
27NC_016396TAT455048550581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_016396TAA456217562281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016396ATG457420574311233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016396AAT458180581901166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_016396CAT458334583451233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
32NC_016396CTG45864958659110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
33NC_016396CTT45994859958110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
34NC_016396TAG462905629151133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016396GCG46392563935110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
36NC_016396AGT465792658041333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
37NC_016396TAT469457694671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_016396GAA470499705101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
39NC_016396CAG471420714311233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
40NC_016396TTA572437724521633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
41NC_016396CGA473013730231133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
42NC_016396TCT47574075751120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
43NC_016396TCT47637776388120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
44NC_016396TGC48134981360120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
45NC_016396GCT48245482465120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
46NC_016396TGA482857828681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016396GAA482901829121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
48NC_016396CAT486172861831233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
49NC_016396AGT490894909051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016396GAA494678946891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016396AGC495467954781233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
52NC_016396TCG49561795629130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
53NC_016396ATA81002111002322266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_016396ATA41014441014541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016396GTC4102285102296120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
56NC_016396TTC4105271105281110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
57NC_016396CTT4105419105431130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
58NC_016396GAA51097771097901466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
59NC_016396GTC4109999110010120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
60NC_016396AGT41102291102411333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
61NC_016396AAG41118971119071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016396AGA41138101138211266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35805111
63NC_016396AAG41139001139111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35805111
64NC_016396ATA51146071146211566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
65NC_016396AAG41162781162891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
66NC_016396CTT4116718116730130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
67NC_016396TCT4119726119737120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
68NC_016396CTT4120898120908110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
69NC_016396CTG4122928122938110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
70NC_016396TCT4123168123178110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
71NC_016396TCA41247021247131233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
72NC_016396ACT41273461273561133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
73NC_016396CTT4127744127755120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
74NC_016396CTT4128429128441130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
75NC_016396ATA41300711300821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016396TCT4131705131716120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
77NC_016396CTT4134680134690110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
78NC_016396CTC4136901136911110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
79NC_016396TAG41378881378991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
80NC_016396TCC4139645139656120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
81NC_016396GAA41438901439011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016396TCT4145542145553120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
83NC_016396GGA41483751483861233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
84NC_016396TAG51527461527591433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
85NC_016396CTC4154412154423120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
86NC_016396CTT7161017161035190 %66.67 %0 %33.33 %10 %Non-Coding