ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 2

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016396AAAG32882981175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
2NC_016396GAA45505611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016396A1497698914100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_016396CTTT321742186130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
5NC_016396CTT423792389110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
6NC_016396TCT531053118140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
7NC_016396CTTTA3380738211520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
8NC_016396A134157416913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_016396TCT443634374120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
10NC_016396GAA4514251531266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016396CGG452135224120 %0 %66.67 %33.33 %8 %Non-Coding
12NC_016396AATG3840484141150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
13NC_016396CAT4886688771233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_016396AATA310729107411375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
15NC_016396CTTT41092710943170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
16NC_016396AAAG313579135901275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
17NC_016396CTA414285142951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_016396TTC41517215182110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
19NC_016396TTA415255152661233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016396TGAATC315577155941833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
21NC_016396TTTC31691416924110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
22NC_016396AGC417462174731233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_016396TTA420456204671233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_016396GAAA321443214541275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
25NC_016396AAGGA323171231841460 %0 %40 %0 %7 %Non-Coding
26NC_016396TCTT32388423894110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
27NC_016396A15242952430915100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_016396GCTT32441824429120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
29NC_016396AGCT324737247471125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
30NC_016396AACT325595256061250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
31NC_016396TAG426324263351233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016396AGA427473274851366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016396TG62902129031110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016396A12292672927812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_016396T122951529526120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_016396ATCA329621296321250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
37NC_016396ATTC330734307451225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
38NC_016396TTA431793318051333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
39NC_016396TAAG332307323181250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
40NC_016396TA734057340691350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_016396CTT53472934744160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
42NC_016396AG635971359821250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
43NC_016396CTTTT33727037283140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
44NC_016396A13377903780213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
45NC_016396T173843838454170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
46NC_016396TGT43973039740110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016396T163988639901160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
48NC_016396GAA440071400821266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
49NC_016396GACT440522405371625 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
50NC_016396GAAT341515415251150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
51NC_016396AAG441918419301366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
52NC_016396GCTA343120431311225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
53NC_016396TA644182441921150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_016396GAA444813448251366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
55NC_016396GAA444987449991366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016396TGA445148451591233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
57NC_016396GATA345637456481250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
58NC_016396TAGT346449464601225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
59NC_016396GAAA346576465861175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
60NC_016396CGAA347148471581150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
61NC_016396TA648031480411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016396TAT448879488891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_016396GTA449145491561233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016396TA749342493541350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
65NC_016396TAT450132501431233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
66NC_016396AAGA351304513151275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
67NC_016396TA651412514231250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_016396ACTC352021520311125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
69NC_016396TATTCC352251522671716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
70NC_016396ATAG353596536061150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
71NC_016396CAG554736547511633.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
72NC_016396ACAG354928549381150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
73NC_016396TTAT355019550311325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
74NC_016396TAT455048550581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
75NC_016396GATA355867558771150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
76NC_016396TAA456217562281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
77NC_016396A13571115712313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_016396TA757275572881450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
79NC_016396ATG457420574311233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
80NC_016396AAT458180581901166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_016396CAT458334583451233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
82NC_016396CTG45864958659110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
83NC_016396CTT45994859958110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
84NC_016396A14614646147714100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
85NC_016396TAG462905629151133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016396GCG46392563935110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
87NC_016396AGT465792658041333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
88NC_016396GAAA366098661091275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
89NC_016396TAAA366671666831375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_016396ACAG367126671361150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
91NC_016396TAGA367578675881150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
92NC_016396TCGA368987689971125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
93NC_016396CTTTT36918969203150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
94NC_016396TAT469457694671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
95NC_016396GAA470499705101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
96NC_016396GA670637706481250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
97NC_016396CAG471420714311233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
98NC_016396TTA572437724521633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
99NC_016396CGA473013730231133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
100NC_016396T127320573216120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
101NC_016396TA673303733131150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
102NC_016396TTTC47466374677150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
103NC_016396TCT47574075751120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
104NC_016396AGAA376252762631275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
105NC_016396TCT47637776388120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
106NC_016396ATTA377752777631250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_016396TTGC37887678886110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
108NC_016396AAGA380414804251275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
109NC_016396TGC48134981360120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %Non-Coding
110NC_016396AAAG382008820191275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
111NC_016396T148210582118140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
112NC_016396TTCT38225982270120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
113NC_016396GATC382304823141125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
114NC_016396GCT48245482465120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
115NC_016396TGA482857828681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
116NC_016396GAA482901829121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
117NC_016396TTGA383108831181125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
118NC_016396ACATA383121831351560 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
119NC_016396GATC383616836271225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
120NC_016396CCAAG384803848181640 %0 %20 %40 %6 %Non-Coding
121NC_016396CAT486172861831233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
122NC_016396AAGA387534875451275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
123NC_016396TTCT38825188262120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
124NC_016396AGGG388550885601125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
125NC_016396CCAAG388575885891540 %0 %20 %40 %6 %Non-Coding
126NC_016396GTTT39087390884120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
127NC_016396AGT490894909051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
128NC_016396TA691584915941150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
129NC_016396TTTAT393204932191620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
130NC_016396AGGG394577945881225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
131NC_016396GAA494678946891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
132NC_016396ACTG394809948211325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
133NC_016396GAAA394925949371375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
134NC_016396AGAA395022950331275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
135NC_016396AGC495467954781233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
136NC_016396TCG49561795629130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
137NC_016396TA695850958611250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
138NC_016396AAGT395992960021150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
139NC_016396AT696681966911150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_016396AT697604976141150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
141NC_016396TAAA398934989451275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
142NC_016396CAGA31001261001361150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
143NC_016396ATA81002111002322266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
144NC_016396TA61003901004001150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
145NC_016396ATA41014441014541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
146NC_016396GTC4102285102296120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
147NC_016396ATTT31028511028631325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
148NC_016396CTTA31048591048691125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
149NC_016396TTC4105271105281110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
150NC_016396CTT4105419105431130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
151NC_016396TA61080311080411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
152NC_016396CTTT3108282108293120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
153NC_016396CTTAG31086721086851420 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
154NC_016396GAA51097771097901466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
155NC_016396GTC4109999110010120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
156NC_016396AGT41102291102411333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
157NC_016396GAAA31107361107461175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
158NC_016396AAG41118971119071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
159NC_016396AGA41138101138211266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35805111
160NC_016396AAG41139001139111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %35805111
161NC_016396GAAT31139981140091250 %25 %25 %0 %8 %35805111
162NC_016396GAAAA31143141143281580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
163NC_016396ATA51146071146211566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
164NC_016396T19115348115366190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
165NC_016396AAG41162781162891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
166NC_016396CTT4116718116730130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
167NC_016396TTAG31168421168531225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
168NC_016396CTTA31175161175281325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
169NC_016396TCT4119726119737120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
170NC_016396GGATAT31201081201241733.33 %33.33 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
171NC_016396CTT4120898120908110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
172NC_016396T17122273122289170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
173NC_016396AATTT41226841227032040 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
174NC_016396CTG4122928122938110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
175NC_016396TCT4123168123178110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
176NC_016396TCA41247021247131233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
177NC_016396AGAA31262051262171375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
178NC_016396ACT41273461273561133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
179NC_016396CTT4127744127755120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
180NC_016396TGTT3127905127916120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
181NC_016396CTT4128429128441130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
182NC_016396TTTTG3128696128710150 %80 %20 %0 %0 %Non-Coding
183NC_016396TAAG31293141293241150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
184NC_016396ATA41300711300821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
185NC_016396GCTT3130092130102110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
186NC_016396GAAA31302841302941175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
187NC_016396TATT31303601303721325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
188NC_016396ACTT31306631306741225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
189NC_016396TCTA31314161314271225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
190NC_016396TCT4131705131716120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
191NC_016396TA61317531317631150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
192NC_016396ACTA31320551320671350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
193NC_016396AT61321861321961150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
194NC_016396T17132560132576170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
195NC_016396TGTTT4132643132662200 %80 %20 %0 %5 %Non-Coding
196NC_016396CTTA41337761337921725 %50 %0 %25 %5 %Non-Coding
197NC_016396CTTTT3133886133899140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
198NC_016396GT6134327134338120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
199NC_016396CTT4134680134690110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
200NC_016396GA61353661353761150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
201NC_016396T14135580135593140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
202NC_016396AACT31362701362801150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
203NC_016396CTC4136901136911110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
204NC_016396TTCC3137657137668120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
205NC_016396TAG41378881378991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
206NC_016396AAAG31382761382861175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
207NC_016396TCC4139645139656120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
208NC_016396ATCTCT31398251398431916.67 %50 %0 %33.33 %10 %Non-Coding
209NC_016396AAAG31399831399941275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
210NC_016396A1214172214173312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
211NC_016396ATTC31430061430161125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
212NC_016396TTTG3143785143795110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
213NC_016396TC6143820143830110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
214NC_016396GAA41438901439011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
215NC_016396CTTA31451851451961225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
216NC_016396TCT4145542145553120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
217NC_016396AACA31473791473901275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
218NC_016396AGAA31480781480891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
219NC_016396GGA41483751483861233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
220NC_016396ATTACA31493931494091750 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
221NC_016396TGCCT3150317150330140 %40 %20 %40 %7 %Non-Coding
222NC_016396TAG51527461527591433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
223NC_016396CTC4154412154423120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
224NC_016396GCAA31547231547331150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
225NC_016396ACTT31555931556031125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
226NC_016396ACAT31561581561691250 %25 %0 %25 %0 %Non-Coding
227NC_016396AAGA31573021573131275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
228NC_016396CTTTTT3158197158214180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
229NC_016396CCTT3158326158336110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
230NC_016396AAAG31592171592281275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
231NC_016396T12160117160128120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
232NC_016396TA71604281604401350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
233NC_016396CTT7161017161035190 %66.67 %0 %33.33 %10 %Non-Coding
234NC_016396TTCTT3161106161120150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding