ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 56

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016395	CGA	4	1268	1279	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016395	ACT	4	2363	2374	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016395	TAA	4	3883	3894	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016395	CAAA	3	4026	4037	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016395	TAC	4	4571	4582	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016395	ATCT	3	6449	6459	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016395	AAGT	3	9281	9292	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016395	CT	7	11123	11137	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016395	TTC	4	12993	13004	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016395	AGA	4	14325	14336	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016395	AAG	4	15661	15671	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016395	AGA	4	15826	15837	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016395	AAAG	3	16268	16279	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016395	ATAC	3	16577	16588	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016395	TATAT	3	16655	16669	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016395	A	13	16807	16819	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016395	TATAAT	3	17205	17223	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_016395	AGA	4	17500	17511	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016395	AT	7	17640	17654	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016395	CTTT	3	17792	17803	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016395	AGT	4	18166	18177	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016395	GAAA	3	18385	18396	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016395	TTA	4	18957	18967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016395	AAGA	3	19673	19684	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016395	TA	6	20192	20202	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016395	AAAAAG	3	20431	20448	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_016395	TTC	4	21735	21745	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016395	AT	6	22289	22299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016395	GATT	3	22742	22753	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016395	ATA	5	22909	22923	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016395	CTTT	3	23007	23018	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016395	CTTTAC	3	23081	23098	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016395	TCTT	3	23225	23236	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016395	T	12	23483	23494	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016395	TCAT	3	23716	23726	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016395	CTT	4	24400	24411	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016395	AAG	4	25279	25290	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016395	AAGA	3	26209	26220	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016395	CATT	3	26708	26720	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016395	GAAA	3	26782	26793	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016395	CCAC	3	26838	26848	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016395	TGGG	3	26953	26963	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016395	CTTT	4	27221	27235	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016395	AGAAA	3	27863	27877	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016395	AAGAA	3	28501	28514	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016395	ATATT	4	28695	28713	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016395	TAA	5	29418	29431	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016395	TACTT	3	34232	34245	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016395	TATAT	3	34870	34883	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016395	GAAA	3	35563	35573	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016395	A	13	37444	37456	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016395	TAGTC	3	37792	37805	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016395	AT	9	38452	38468	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016395	T	13	39215	39227	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016395	TAGA	3	39337	39348	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016395	TCTA	3	40240	40251	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016395	TAT	5	40511	40525	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016395	T	14	40534	40547	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016395	AAAG	3	41357	41368	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016395	TTCATG	3	41541	41558	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
61	NC_016395	A	18	41571	41588	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016395	TA	6	41619	41629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016395	AG	6	41791	41801	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016395	CACT	3	42560	42570	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016395	TC	6	42666	42677	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016395	TTC	4	43188	43198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016395	TCT	4	45252	45263	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016395	CTGT	3	45911	45921	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016395	GTA	4	47802	47813	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016395	TA	6	48473	48483	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016395	TTCTT	3	49231	49244	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016395	GAA	4	49396	49406	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016395	T	12	52905	52916	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016395	ATTC	3	53334	53345	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016395	GTAGT	3	53493	53506	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016395	A	13	55408	55420	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016395	TTGC	3	56026	56037	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016395	TCGA	3	56555	56566	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016395	CTT	4	58500	58510	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016395	TATC	3	58604	58615	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016395	TCT	4	58732	58743	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016395	TA	7	59495	59508	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016395	TTGACT	3	59558	59574	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016395	AGAAA	3	59690	59703	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016395	TATAG	3	60477	60492	16	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016395	AG	6	60656	60667	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016395	TAGC	3	60903	60914	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016395	TTCC	3	61300	61310	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016395	TTG	4	61968	61979	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016395	TTC	4	62966	62977	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016395	TTTG	3	63344	63354	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016395	GAA	4	63624	63635	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016395	GAA	4	63684	63695	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016395	AGTG	3	64857	64867	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016395	CTTT	3	65665	65675	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016395	GAA	4	65692	65702	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016395	TAT	4	65804	65817	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016395	ATGA	3	66400	66411	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016395	CTTT	3	66477	66487	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016395	TAG	4	66533	66543	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016395	CATAA	3	66627	66641	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016395	AATG	3	67209	67220	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	35805110
103	NC_016395	CAT	4	68083	68093	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35805110
104	NC_016395	ATA	4	68162	68173	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35805110
105	NC_016395	AAG	4	68303	68314	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016395	TAA	4	69075	69086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016395	TAAA	3	69199	69210	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016395	AGAA	3	69309	69320	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016395	CTTTAA	3	69424	69441	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016395	TTTAAT	3	69480	69497	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016395	TTTC	3	69757	69768	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016395	TAT	4	70140	70152	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016395	AAG	4	71918	71928	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016395	TAAA	3	72148	72160	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016395	TAAA	3	72510	72521	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016395	TAG	4	72530	72540	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016395	TTGT	3	72641	72652	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016395	TAAGG	3	73980	73993	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016395	TTATC	3	74313	74326	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016395	T	13	74331	74343	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016395	ATTT	3	74878	74889	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016395	TTA	4	75143	75154	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016395	GCAA	3	77013	77024	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016395	CAA	4	77764	77775	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016395	TCAA	3	78916	78927	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016395	TCC	4	79225	79235	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016395	TTTAAA	4	79244	79267	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016395	TAC	4	79470	79482	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016395	TAGGA	3	80443	80456	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016395	ATAA	3	81382	81393	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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