ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 59

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016394	TCGT	3	552	563	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016394	CGAG	3	704	715	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016394	CTT	5	3316	3329	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016394	CTA	4	3866	3876	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016394	TTC	4	4074	4086	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016394	TTAG	3	4320	4331	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016394	AAAG	3	4332	4343	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016394	TTA	4	4455	4465	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016394	G	16	5607	5622	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016394	ACT	4	5935	5945	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016394	CTTT	3	6577	6587	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016394	AATAA	3	6687	6700	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016394	CTTT	3	7946	7956	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016394	ATTTC	3	8222	8236	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016394	CTTC	3	8311	8321	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016394	TCT	4	8437	8448	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016394	TAG	4	8571	8581	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016394	T	14	8933	8946	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016394	TGTT	3	9362	9373	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016394	CTT	4	9523	9534	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016394	TA	6	10942	10952	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016394	TAG	4	12119	12130	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016394	AAAG	3	12414	12424	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016394	T	12	12776	12787	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016394	TTAG	3	12996	13007	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016394	AGA	4	13402	13413	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016394	AAGA	3	13854	13865	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016394	TTAA	3	14121	14132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016394	AT	6	14669	14679	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016394	ATTC	3	14944	14954	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016394	TA	6	15266	15277	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016394	AATAA	3	16214	16227	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016394	AGC	4	17293	17304	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016394	TAG	4	18814	18824	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016394	TCT	4	19607	19618	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016394	AGA	4	19873	19883	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016394	CCTT	3	21512	21522	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016394	TTTG	3	22746	22756	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016394	TA	7	23253	23265	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016394	AATTT	4	23302	23320	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_016394	TGCT	3	23577	23588	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016394	AGAA	4	25127	25142	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016394	TAT	4	27065	27075	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016394	TAT	4	29841	29853	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016394	GAA	4	30377	30389	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016394	CTTT	4	30661	30676	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016394	GTAG	3	30912	30923	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016394	A	12	30936	30947	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016394	TCT	4	30953	30964	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016394	CT	6	32817	32827	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016394	GAAT	3	33319	33330	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016394	TTA	4	33953	33964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016394	TCAA	3	36047	36058	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016394	TC	6	36543	36553	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016394	GAA	4	36841	36852	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016394	A	16	37333	37348	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016394	TTTTC	3	39684	39698	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016394	TTTA	3	40004	40015	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016394	CTTAAA	3	42006	42023	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
60	NC_016394	CTTT	3	42396	42407	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016394	CAAG	3	42564	42574	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016394	TTC	4	42668	42679	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016394	A	13	42827	42839	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016394	CTTT	3	43258	43268	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016394	GAA	4	43285	43295	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016394	TAT	4	43397	43410	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016394	ATGA	3	43993	44004	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016394	CTTT	3	44070	44080	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016394	TAG	4	44126	44136	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016394	CATAA	3	44220	44234	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016394	AATG	3	44802	44813	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	35805110
72	NC_016394	CAT	4	45676	45686	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35805110
73	NC_016394	ATA	4	45755	45766	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35805110
74	NC_016394	AAG	4	45896	45907	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016394	TAA	4	46668	46679	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016394	TAAA	3	46792	46803	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016394	AGAA	3	46902	46913	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016394	CTTTAA	3	47017	47034	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016394	TTTAAT	3	47073	47090	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016394	TTTC	3	47350	47361	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016394	TAT	4	47733	47745	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016394	AT	6	51142	51152	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016394	TAAA	3	51723	51734	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016394	TA	6	52393	52403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016394	TACT	4	52615	52630	16	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016394	T	12	53370	53381	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016394	AACT	3	53743	53754	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016394	ATT	4	53765	53775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016394	ATTAT	3	54268	54282	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016394	TTAG	4	54380	54396	17	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_016394	GTAA	3	54738	54749	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016394	AAC	4	54831	54842	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016394	TA	6	55150	55160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016394	TGTA	3	55212	55222	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016394	AAAGT	3	56112	56125	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016394	AAC	4	56868	56879	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016394	GAA	4	56988	56998	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016394	TCTT	3	58377	58387	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016394	TCC	4	58599	58611	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016394	AGA	5	58688	58702	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016394	AACGA	3	58703	58716	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016394	AAGA	3	59848	59858	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016394	T	13	60668	60680	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016394	AAC	4	60994	61004	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016394	A	15	61049	61063	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016394	AAAG	3	61368	61378	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016394	AT	7	61562	61574	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016394	CTTC	3	61637	61649	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016394	TCT	4	62977	62988	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016394	TGAG	3	66248	66259	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

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