ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 1

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016393AAAG3327632871275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
2NC_016393GCTT354185428110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
3NC_016393GCCT357765786110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
4NC_016393TTTC363346345120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
5NC_016393AAGA4742874431675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
6NC_016393AGAA310422104331275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
7NC_016393ATTA311854118641150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016393ACTT312662126741325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
9NC_016393CTAT312685126951125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
10NC_016393GGAA313790138011250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016393CTTT31480814819120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016393GAAA319155191661275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016393ACTT319743197541225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
14NC_016393ATTC320401204131325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
15NC_016393CTTT32182521835110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
16NC_016393TGAG324317243281225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
17NC_016393AGAA325391254021275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
18NC_016393CCAG326082260931225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
19NC_016393AAGA327411274221275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016393TTTA328084280951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_016393TTTC33019230202110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
22NC_016393CAGC331825318361225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
23NC_016393AAGA432434324491675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
24NC_016393CATC333100331111225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
25NC_016393AAGA344178441891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
26NC_016393AGTA349377493881250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
27NC_016393CTTT34977449785120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
28NC_016393CTTT35045650468130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
29NC_016393ATCC350546505571225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
30NC_016393AAGC351003510141250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
31NC_016393AATT351317513281250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016393GGAA353567535771150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
33NC_016393CAAG359444594541150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
34NC_016393CTTT36479764808120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
35NC_016393TTTC36875868768110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
36NC_016393CTTT37114171152120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
37NC_016393CTTT37396273973120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
38NC_016393CCAG374252742641325 %0 %25 %50 %7 %Non-Coding
39NC_016393CTTG47435674371160 %50 %25 %25 %6 %Non-Coding
40NC_016393AGAA379780797911275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
41NC_016393CAAA382569825801275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
42NC_016393AAAG383562835721175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016393CTTT38458184591110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
44NC_016393TGCT38852188531110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
45NC_016393AGTC390659906701225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
46NC_016393TCAG391125911351125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
47NC_016393TTCT49125391269170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
48NC_016393TCTT39393193941110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
49NC_016393CTGA395547955581225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
50NC_016393GCTT39784197853130 %50 %25 %25 %7 %Non-Coding
51NC_016393CTTT39844598456120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
52NC_016393ATAA31019231019341275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016393CTTT3102362102372110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_016393AAAG31026511026621275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016393AAAG31028821028941375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016393CTTT3103619103630120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
57NC_016393AAAG31054681054781175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016393CTTT3108152108163120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
59NC_016393CTTT3109480109490110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
60NC_016393ATAA31110151110261275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016393AAGC31119481119581150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
62NC_016393GCTA31136101136211225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
63NC_016393ATTT31150151150271325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
64NC_016393GAAA31168321168431275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016393AAAG31175061175161175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016393AAAG31179971180071175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
67NC_016393AAGC31200391200501250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
68NC_016393TTAA31239861239971250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016393AAAG31272891273001275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016393GAAA31280611280711175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
71NC_016393GAAA31294221294331275 %0 %25 %0 %0 %35805110
72NC_016393GAAA31363061363171275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
73NC_016393CTTT3136833136843110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
74NC_016393CGAG31372651372761225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
75NC_016393TGAG31381451381561225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016393CTTC3140613140625130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
77NC_016393AAAT31411011411111175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_016393GGCT3141620141631120 %25 %50 %25 %0 %Non-Coding
79NC_016393TAAT31449961450071250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
80NC_016393AAGG31530981531101350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
81NC_016393TACC31569931570051325 %25 %0 %50 %7 %Non-Coding
82NC_016393CAAA31596161596271275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
83NC_016393GTTA31597041597151225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
84NC_016393AATT31607181607291250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_016393CCTG3160914160925120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
86NC_016393TCAG31615761615861125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
87NC_016393AAGG31667571667681250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
88NC_016393TTTC3169637169647110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
89NC_016393AGTA31741301741401150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
90NC_016393AAAG31744371744491375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
91NC_016393CCGA31792711792821225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
92NC_016393CTTT3183363183374120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
93NC_016393AGAA31865751865871375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
94NC_016393GGCA31875681875791225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
95NC_016393ATAG41896431896591750 %25 %25 %0 %5 %Non-Coding
96NC_016393TCCA31902371902491325 %25 %0 %50 %7 %Non-Coding