Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 1

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016393TTC411271137110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
2NC_016393TCT425912602120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_016393TCT453265338130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
4NC_016393TAA4686468751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016393TAG4733573461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016393TTA414980149921333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016393ATA414992150021166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016393CTT41596715977110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
9NC_016393TAG418844188541133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016393CTT42296522976120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_016393CTT42366523675110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
12NC_016393TCA424471244821233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
13NC_016393CTT42465524666120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_016393TGT42656526575110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
15NC_016393TCT43144931459110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
16NC_016393GCT43380433815120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
17NC_016393AAT434354343651266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016393AGA536439364521466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016393ACT437083370941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_016393AGA437987379971166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016393TGC44037440385120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_016393TTG44138041391120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
23NC_016393TAA442747427581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016393CTT44367743687110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
25NC_016393CTT44595445965120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_016393AAG448653486641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
27NC_016393GAA449602496131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016393GAT450777507881233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016393ATG452782527941333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
30NC_016393ATA453166531761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_016393CTT45627856288110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
32NC_016393TTA461866618771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_016393CTA464097641071133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
34NC_016393AGA464399644091166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016393AGA466822668321166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
36NC_016393TTA467110671201133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_016393GAA467282672941366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
38NC_016393CAT475304753141133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
39NC_016393AGA477914779251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016393CTT47802178033130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
41NC_016393CAT479283792931133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
42NC_016393GAA481908819181166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016393CGA482069820791133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
44NC_016393ACT482982829931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
45NC_016393AGT489471894821233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
46NC_016393TTC48967289684130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
47NC_016393AGA491428914391266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
48NC_016393CTT49787897889120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
49NC_016393GAA41041721041821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
50NC_016393GAA41073251073351166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
51NC_016393GAA41080181080281166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
52NC_016393TCT4109415109426120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
53NC_016393CAT41097881097991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
54NC_016393TAG41169251169351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016393TAA41194051194151166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_016393TCT4120142120153120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
57NC_016393AGC41207311207411133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
58NC_016393CAA41236581236691266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
59NC_016393TCA41256821256931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
60NC_016393GAA41282011282111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
61NC_016393TTC4132003132014120 %66.67 %0 %33.33 %8 %35805109
62NC_016393TAG41341961342061133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
63NC_016393GAA41342931343041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016393AGT41357221357321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
65NC_016393TCT4136684136694110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
66NC_016393CTT4137084137094110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
67NC_016393AAG41419651419761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
68NC_016393TAC41420671420781233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
69NC_016393AAG41438141438251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016393CTT4147928147940130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
71NC_016393TCT4150197150207110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
72NC_016393TTC4152947152957110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
73NC_016393TTA41599781599891233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_016393GTA41608081608201333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
75NC_016393TAA41610531610641266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
76NC_016393GTA41656921657021133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
77NC_016393TTA41685981686081133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_016393TAC41705241705341133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
79NC_016393ATC41772751772861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
80NC_016393TCT4181250181261120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
81NC_016393TTC4181925181935110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
82NC_016393AGT41825861825971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
83NC_016393TGA41826891826991133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
84NC_016393CAT51863831863961433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
85NC_016393GAA41893551893661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
86NC_016393TGA41899271899371133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding