ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 45

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016392	GAA	4	1476	1487	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016392	TACTTG	3	2255	2271	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016392	CTTT	3	2281	2291	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016392	GGC	4	2329	2340	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016392	GATG	3	3195	3206	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016392	GCA	4	4491	4501	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016392	CTTTCT	3	7683	7700	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
8	NC_016392	CATT	3	8615	8626	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016392	TCT	4	9663	9674	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016392	TCA	4	9831	9841	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016392	AATC	3	9981	9993	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016392	TTTTG	3	10061	10075	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016392	A	15	10410	10424	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016392	GAA	4	10673	10684	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016392	ACTT	3	11194	11205	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016392	TTCCC	3	12114	12128	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016392	GCTT	3	12734	12744	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016392	CTT	4	12748	12758	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016392	TCA	4	12857	12869	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016392	AAAG	3	12964	12976	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016392	GCCA	3	14860	14870	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016392	GCA	4	15920	15931	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016392	CTA	4	16546	16557	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016392	TTAG	3	17262	17272	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016392	CA	6	17738	17749	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016392	TAA	4	18962	18972	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016392	GAATCT	3	20209	20226	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016392	CT	6	20604	20614	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016392	TCT	4	21691	21702	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016392	AACTT	3	21802	21815	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016392	CTT	4	22002	22013	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016392	ATA	4	22178	22188	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016392	AGG	4	22236	22247	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016392	CTTA	3	22732	22743	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016392	A	12	22939	22950	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016392	TA	6	23938	23948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016392	TAGC	4	24350	24364	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016392	TA	6	24516	24526	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016392	TCTT	3	25154	25164	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016392	TA	8	25389	25403	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016392	AAGT	3	25784	25795	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016392	CTTT	3	26156	26167	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016392	GAAA	3	26308	26319	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016392	CTT	4	27974	27985	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016392	A	13	28034	28046	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016392	TCTT	3	28072	28083	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016392	ATAC	3	28229	28239	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016392	A	12	28250	28261	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016392	AGA	5	28758	28772	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016392	GGCTT	3	29210	29225	16	0 %	40 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016392	TCAA	3	29521	29532	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016392	CTTT	3	29703	29714	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016392	T	13	31091	31103	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016392	TTTA	3	31583	31595	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016392	AAAG	3	31797	31808	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016392	AAGT	3	32223	32234	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016392	CT	7	33562	33575	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016392	CTTAG	4	33783	33801	19	20 %	40 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
59	NC_016392	TTTA	3	35043	35053	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016392	CTTT	3	35145	35156	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016392	TTTC	3	36251	36261	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016392	TCTT	3	36710	36721	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016392	TAG	4	37027	37038	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016392	TTTA	3	37650	37660	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016392	T	14	38048	38061	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016392	TA	6	38538	38548	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016392	TAAG	3	38884	38895	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016392	TGGC	3	39311	39321	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016392	ACT	4	40403	40413	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016392	AGGG	3	40763	40773	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016392	TTTTTC	3	42164	42182	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
72	NC_016392	TCTT	3	42824	42835	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016392	TAT	4	44260	44270	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016392	CTAAG	3	44418	44432	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016392	CGAA	3	44443	44454	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016392	ATT	4	44487	44498	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016392	AAC	4	46065	46076	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016392	TCCA	3	46109	46120	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016392	CTT	4	46444	46455	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016392	CTT	5	49921	49936	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016392	TTCA	3	50333	50344	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016392	TATG	3	50389	50401	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016392	CCTTT	3	51640	51653	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016392	CT	6	52402	52412	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016392	ATA	5	53241	53254	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016392	AAAG	3	55345	55355	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016392	TCATAG	3	55781	55797	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
88	NC_016392	A	13	56338	56350	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016392	AAGA	3	58210	58221	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016392	AAAGT	3	58603	58617	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016392	TATAGA	3	58719	58736	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016392	CTTA	3	58926	58938	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016392	AATAGA	3	59171	59188	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_016392	AGAA	5	60345	60364	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
95	NC_016392	CGAGAA	3	61127	61144	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016392	CTT	4	61202	61213	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016392	GAAG	3	61800	61812	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016392	AAAG	3	63663	63674	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016392	A	13	64136	64148	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016392	GAAT	3	64230	64241	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016392	AAAGG	3	66029	66043	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016392	TCA	4	66264	66274	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016392	GCTTT	3	66345	66358	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016392	TGG	4	66876	66887	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016392	AGAA	3	66995	67006	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016392	CTT	4	67546	67556	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016392	A	12	67574	67585	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016392	AAGA	3	68252	68263	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016392	AT	6	68327	68337	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016392	CAAAAG	3	68553	68571	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
111	NC_016392	ATCTT	3	69268	69282	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016392	TTGA	3	70544	70555	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016392	TAGT	4	70798	70813	16	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016392	TAT	4	70932	70942	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016392	AAGA	3	71439	71450	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016392	TTA	4	72406	72417	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016392	AGATAG	3	72489	72505	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016392	TTA	5	72719	72732	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016392	CGAT	3	73229	73240	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016392	AGGA	3	73718	73729	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016392	TTCT	3	74594	74606	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016392	AGTG	3	74815	74825	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016392	CTTT	3	74918	74929	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016392	ATCT	3	75303	75314	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016392	GCT	4	75660	75670	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016392	TCTT	3	75708	75720	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016392	AGGA	3	76002	76013	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016392	TCTT	3	76291	76301	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016392	TAAG	3	77259	77271	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016392	CTT	4	77375	77385	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016392	CCTCTC	3	77567	77583	17	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
132	NC_016392	TTCT	3	78098	78108	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016392	TGA	4	78529	78540	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016392	TGG	4	78622	78633	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016392	TCTT	4	78656	78671	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016392	TA	9	79878	79894	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_016392	CTT	4	83489	83499	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016392	TCAA	3	83696	83706	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016392	TTGA	3	83983	83994	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016392	T	13	84723	84735	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016392	AAGC	3	84806	84817	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016392	TA	6	84992	85003	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016392	CTAT	4	85592	85607	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
144	NC_016392	AT	6	85914	85924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016392	TTAAT	3	87149	87164	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
146	NC_016392	TAGTA	3	89167	89180	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016392	AAT	4	89550	89560	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016392	TTTG	3	89769	89779	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016392	T	13	91202	91214	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_016392	ATTTA	3	91247	91261	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016392	TTCT	3	91784	91796	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
152	NC_016392	GGAA	3	92881	92892	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016392	AAAT	3	95258	95268	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016392	TGG	4	95315	95326	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 45