ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 27

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016391	TC	7	117	129	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016391	CTT	4	2894	2905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016391	TAT	4	6230	6242	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016391	AT	6	6625	6636	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016391	AT	7	7252	7265	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016391	ATCT	3	8200	8210	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016391	TTA	4	8782	8792	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016391	AG	7	9590	9603	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016391	AG	6	9903	9913	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016391	CTC	4	10836	10847	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016391	TCT	4	10988	11000	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016391	CT	6	11374	11384	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016391	AGAAAA	3	11996	12013	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_016391	TGC	4	12608	12619	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016391	TCA	4	13511	13521	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016391	CT	6	14302	14313	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016391	TTATA	3	14651	14664	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016391	CAA	4	14965	14975	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016391	CTTT	3	16346	16357	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016391	AAG	4	16374	16384	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016391	GTAA	3	16708	16720	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016391	CATTT	3	16749	16762	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016391	AACT	3	17972	17983	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016391	TTAT	3	18751	18762	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016391	AAAG	3	19346	19356	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016391	CTTT	3	20228	20239	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016391	AGT	4	20616	20627	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016391	TAATAG	3	20657	20673	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016391	A	13	21870	21882	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016391	GA	6	22146	22156	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016391	ACCT	3	22322	22333	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016391	GGGC	3	22636	22648	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016391	GGAA	3	24098	24108	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016391	TAT	4	25642	25652	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016391	AAAG	3	26081	26091	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016391	AGTAA	3	27792	27806	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016391	GGAAGG	3	28559	28576	18	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016391	TCT	4	29007	29018	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016391	AGGG	3	29888	29899	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016391	AT	6	30138	30148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016391	GGAAAA	3	31348	31365	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016391	GGAT	3	31598	31609	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016391	CTTT	3	32060	32071	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016391	CAC	4	32563	32573	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016391	AAAG	3	33176	33186	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016391	TA	6	33640	33650	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016391	GCT	4	35139	35150	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016391	GCTT	3	35518	35528	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016391	CTTTAG	3	35702	35720	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016391	AG	6	36272	36283	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016391	TAGA	4	36522	36537	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016391	AAAG	3	36680	36691	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016391	ATAAGA	3	37513	37529	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016391	TATG	4	37825	37839	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016391	TAGA	3	38354	38365	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016391	TA	6	40620	40630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016391	TCGA	3	42270	42282	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016391	GAA	4	42326	42337	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016391	GGCG	3	42696	42706	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016391	CT	6	42713	42724	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016391	GAAA	3	43268	43278	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016391	AAGT	3	43430	43441	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016391	CTG	4	43919	43930	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016391	CTT	4	44096	44107	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016391	AG	6	44305	44316	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016391	ATTCTT	3	44559	44576	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
67	NC_016391	AGAT	3	45709	45720	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016391	GATTTA	3	48585	48601	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016391	AAG	4	48854	48864	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016391	TA	6	49724	49734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016391	CTT	4	50128	50138	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016391	AAG	4	50617	50628	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016391	A	13	50790	50802	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016391	TGAAA	3	51071	51084	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016391	TTTGT	3	52131	52144	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016391	ATCG	3	52235	52246	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016391	TCTT	4	53031	53045	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	35805109
78	NC_016391	TCT	4	53952	53964	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35805109
79	NC_016391	CTTTT	3	57712	57726	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016391	T	14	57826	57839	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016391	ACAAA	3	57931	57945	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016391	AAAG	3	58118	58128	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016391	TCT	4	58875	58887	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016391	ACTC	3	59139	59149	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016391	T	14	59455	59468	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016391	GCAA	3	59614	59625	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016391	AAG	4	59953	59963	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016391	AGAA	3	60527	60538	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016391	TA	7	61669	61681	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016391	CTG	4	61871	61882	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016391	TTTCT	3	62241	62255	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016391	CT	6	62828	62838	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016391	AAGA	3	62920	62931	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016391	ATC	4	63151	63162	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016391	ATTACC	3	63400	63417	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016391	AAGG	3	63557	63568	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016391	ATAG	3	64865	64875	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016391	AAG	4	65238	65249	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016391	CT	6	65933	65943	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016391	TCTTG	3	66154	66167	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016391	CTT	4	66414	66426	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016391	TATT	3	67671	67682	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016391	CCT	4	68457	68468	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016391	AAGC	3	69391	69401	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016391	TA	7	69426	69441	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016391	AGA	4	69766	69777	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016391	AGT	5	70009	70023	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016391	CCTT	3	71710	71720	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016391	GCA	4	72437	72448	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016391	TCTT	3	72910	72920	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016391	CTTT	3	74605	74616	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016391	ACTA	3	74911	74923	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016391	TA	6	75731	75741	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016391	TTC	4	75792	75802	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016391	TATAA	4	76330	76349	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016391	TA	6	77946	77956	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016391	CTTT	3	77997	78008	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016391	TTC	4	78147	78157	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016391	AGAA	3	78232	78244	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016391	CT	6	81043	81053	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016391	AGA	4	81124	81135	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016391	CTA	5	81396	81409	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016391	TA	6	81406	81417	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016391	CAAG	3	82885	82895	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016391	ACT	4	83056	83066	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016391	AGG	4	83722	83734	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016391	ATCT	3	86361	86371	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016391	TA	6	86654	86665	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016391	AT	7	87514	87527	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016391	CTCG	3	88510	88521	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016391	AT	9	90007	90024	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
132	NC_016391	TAAG	3	90982	90993	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016391	TA	6	91015	91025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016391	CT	6	91328	91339	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016391	TTCC	3	91346	91357	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016391	CCAACA	3	91568	91585	18	50 %	0 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
137	NC_016391	TA	6	92390	92400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016391	GAA	4	92940	92951	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016391	TAG	4	94682	94692	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016391	TTC	4	95218	95229	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 27