ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 8

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016390	ACCT	3	726	736	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016390	AT	7	2388	2400	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016390	ATTCTT	3	2766	2783	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016390	TA	6	3062	3072	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016390	CAA	4	3320	3330	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016390	TGAA	3	3599	3610	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016390	ATC	4	4868	4879	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016390	TA	7	5109	5121	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016390	A	14	7156	7169	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016390	AAAG	3	7606	7617	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016390	AAAG	3	7837	7847	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016390	GAAA	3	7936	7946	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016390	CTT	4	9493	9504	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016390	ATA	4	9872	9882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016390	TGTC	3	10036	10046	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016390	TAC	4	10192	10202	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016390	GAATCA	3	10485	10503	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
18	NC_016390	GCTA	3	10743	10754	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016390	A	18	12956	12973	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_016390	CTT	4	13433	13443	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016390	TGAA	3	14247	14258	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016390	CTTT	3	16123	16134	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016390	TTC	4	17232	17246	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016390	GTAAA	3	17402	17416	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016390	CTATT	3	17904	17919	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016390	CT	6	18958	18969	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016390	CGA	4	20092	20102	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016390	AGA	4	20572	20583	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016390	CTATAA	3	21719	21735	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
30	NC_016390	CTTT	4	22008	22023	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016390	TA	6	23221	23231	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016390	AGA	4	23327	23338	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016390	TA	6	24929	24939	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016390	CTG	4	25266	25277	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016390	CTA	4	25827	25837	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016390	CTA	4	26763	26774	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016390	GAAA	3	26787	26798	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016390	TTG	4	27092	27103	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016390	TC	6	27861	27871	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016390	AAGA	3	29125	29136	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016390	AAG	4	29671	29682	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016390	CTG	4	30272	30284	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016390	TCT	5	31751	31765	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016390	TTGG	3	33566	33576	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016390	TA	7	33911	33923	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016390	AAG	4	34228	34239	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016390	AATG	3	35526	35536	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016390	GAAA	3	36122	36132	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016390	GA	6	36697	36707	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016390	CAAG	3	36900	36910	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016390	AGAATA	3	39061	39079	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_016390	CTA	4	39694	39704	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016390	TAATTC	3	40028	40050	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016390	A	14	40481	40494	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016390	AAG	4	40514	40525	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016390	A	15	40565	40579	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016390	TAT	4	40826	40837	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016390	A	14	40951	40964	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016390	TA	6	41070	41080	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016390	TTCC	3	42004	42015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016390	TCT	4	42831	42842	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016390	AGAT	3	44030	44041	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016390	AAGT	3	44634	44645	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016390	AGTAT	3	45069	45082	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016390	AAGA	3	45838	45850	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016390	TCTTT	3	49087	49100	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016390	TTA	4	49200	49211	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016390	CCTT	3	50103	50113	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016390	TA	7	51045	51057	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016390	TAA	4	52794	52805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016390	TAG	4	53590	53600	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016390	TA	6	53670	53680	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016390	T	12	54401	54412	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016390	TTATA	5	56437	56460	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016390	TGCC	3	56592	56604	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016390	CTG	4	57024	57035	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016390	GGAA	3	57268	57280	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016390	TCAA	3	59764	59775	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016390	TA	6	59917	59927	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016390	GTA	4	60335	60346	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016390	T	18	62105	62122	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_016390	AAGA	3	63197	63208	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016390	TA	6	64612	64623	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016390	AAAG	3	65132	65143	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016390	GGCTA	3	65294	65307	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016390	TCT	4	67385	67396	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016390	A	15	68983	68997	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016390	ATGA	3	69544	69554	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016390	AAGA	3	71065	71076	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016390	GTCT	3	71437	71447	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016390	AAG	4	71646	71657	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016390	T	17	71866	71882	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_016390	AAAG	3	72541	72552	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016390	CAAA	4	73129	73143	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016390	A	13	73576	73588	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016390	AGAA	3	74461	74472	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016390	CTT	4	74717	74727	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016390	AAAG	3	75234	75245	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016390	CTTA	4	75513	75527	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016390	AAG	4	75712	75723	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016390	GGAA	3	75899	75910	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016390	AAG	4	76018	76028	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016390	AGAT	3	76233	76245	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016390	AG	6	76368	76379	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016390	AAAG	3	77263	77274	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016390	AAG	4	79572	79583	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016390	GAA	4	80186	80197	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016390	CTT	4	80780	80790	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016390	TA	6	81312	81322	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016390	TCA	4	81366	81377	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016390	TTTTC	3	82120	82134	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016390	AGT	4	82274	82285	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016390	TTAT	3	83596	83607	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016390	AGA	5	83739	83752	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016390	CTTT	3	83883	83893	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016390	CA	6	83975	83986	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016390	TCA	4	84156	84167	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016390	T	15	85651	85665	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016390	TTCT	3	85690	85701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016390	TCTTTT	3	86643	86660	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
121	NC_016390	G	14	87882	87895	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016390	GCTT	3	88446	88456	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016390	TCA	4	88573	88584	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016390	ATTAGA	3	88834	88852	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016390	A	13	89306	89318	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016390	AAAAG	3	89986	90000	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016390	GAAG	3	90133	90144	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016390	CTT	5	91526	91540	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016390	TATT	3	92512	92522	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016390	T	15	92967	92981	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016390	TAAG	3	93977	93987	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016390	AAGC	3	94566	94577	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016390	AGA	4	94673	94684	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016390	AAGT	3	94961	94973	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016390	AAGT	4	95254	95269	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016390	AGT	4	95366	95376	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016390	AAGA	3	96373	96384	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016390	A	13	96645	96657	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016390	CTTT	3	96679	96690	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016390	G	13	96779	96791	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
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203	NC_016390	AAGA	4	139639	139654	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 8