ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 21

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016389	ATC	4	2059	2069	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016389	TGA	4	3370	3381	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016389	GAA	4	4670	4682	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016389	CTC	4	6220	6231	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016389	AGA	4	7330	7341	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016389	GAT	4	13405	13416	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016389	CTT	5	15591	15605	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016389	GAA	4	15835	15845	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016389	ATT	5	15864	15878	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016389	CTA	4	16577	16587	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016389	CTC	4	16690	16701	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016389	CTT	4	16966	16977	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016389	TAA	4	18571	18582	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016389	TCA	4	19717	19728	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016389	GAA	4	19968	19979	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016389	TAT	4	20374	20384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016389	CTT	4	20613	20623	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016389	AGA	4	21611	21621	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016389	TTA	4	25239	25251	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016389	TCT	4	25589	25599	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016389	ACT	4	26113	26123	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016389	AGG	4	27196	27207	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016389	TTG	4	33079	33090	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016389	TAC	4	34728	34739	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016389	CAT	4	39991	40002	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016389	TTA	4	40207	40217	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016389	AGA	5	44093	44107	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016389	CAA	4	47244	47255	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016389	AAG	4	48007	48017	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016389	CTT	4	52185	52195	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016389	CAG	4	53732	53743	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016389	TAA	4	55342	55352	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016389	CTT	4	55741	55752	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016389	CAT	4	58366	58377	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016389	AGC	4	61208	61218	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016389	AAT	4	63073	63086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016389	CTC	4	64157	64168	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016389	GAA	4	65720	65731	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016389	CAA	4	67400	67411	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016389	ATC	6	72106	72124	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
41	NC_016389	ATC	4	77086	77097	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016389	AGC	4	82655	82666	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016389	TAC	4	94918	94929	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016389	AGA	4	95599	95609	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016389	GAA	5	95982	95997	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016389	CTT	4	96948	96959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016389	TAG	4	99857	99867	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016389	AGT	4	100716	100726	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016389	CAC	4	104987	104997	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016389	GAA	4	105091	105102	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016389	TTA	4	105638	105649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016389	ACT	4	105990	106001	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016389	CTT	4	109709	109719	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016389	ACA	4	111035	111045	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016389	TTG	4	112993	113004	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016389	TCT	4	113748	113758	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016389	CAA	4	118303	118314	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016389	AGT	4	119051	119063	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016389	CTA	4	121075	121086	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016389	GAG	4	122059	122069	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 21