ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 21

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016389	T	14	893	906	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016389	TAAA	3	1074	1084	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016389	ATC	4	2059	2069	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016389	AT	6	3291	3301	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016389	TGA	4	3370	3381	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016389	CTTT	3	3388	3398	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016389	TAAG	3	3597	3607	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016389	A	14	4570	4583	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016389	GAA	4	4670	4682	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016389	T	12	4743	4754	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016389	T	16	5282	5297	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016389	CTC	4	6220	6231	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016389	AAAG	4	6997	7012	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016389	AGA	4	7330	7341	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016389	TCTTG	3	7824	7837	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016389	GA	6	7992	8003	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016389	ATTTT	3	8415	8429	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016389	AAAG	3	10915	10925	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016389	A	12	11143	11154	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016389	TGTT	3	11962	11972	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016389	CT	6	12266	12277	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016389	CTGG	4	12980	12995	16	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016389	GAT	4	13405	13416	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016389	CTT	5	15591	15605	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016389	AAAAG	3	15627	15641	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016389	GAA	4	15835	15845	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016389	ATT	5	15864	15878	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016389	CTA	4	16577	16587	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016389	CTC	4	16690	16701	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016389	CTT	4	16966	16977	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016389	A	14	18351	18364	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016389	T	12	18494	18505	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016389	TAA	4	18571	18582	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016389	TCA	4	19717	19728	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016389	GAA	4	19968	19979	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016389	ACTA	3	20149	20160	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016389	TAT	4	20374	20384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016389	CTT	4	20613	20623	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016389	TCAT	3	21449	21459	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016389	TCTTT	3	21476	21490	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016389	AGA	4	21611	21621	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016389	TGAT	3	22845	22856	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016389	ATCT	3	25169	25179	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016389	TTA	4	25239	25251	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016389	TATT	3	25268	25279	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016389	TCT	4	25589	25599	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016389	ACT	4	26113	26123	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016389	AGG	4	27196	27207	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016389	AAAG	4	28465	28479	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016389	GACT	3	28864	28875	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016389	AGAA	3	28948	28959	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016389	AT	6	29326	29336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016389	AAGC	3	30696	30707	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016389	TA	6	31662	31672	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016389	TTG	4	33079	33090	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016389	TAC	4	34728	34739	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016389	A	12	37553	37564	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016389	A	12	37849	37860	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016389	CAT	4	39991	40002	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016389	TTA	4	40207	40217	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016389	TATTT	4	42529	42548	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016389	AAAG	3	43275	43286	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016389	AGA	5	44093	44107	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016389	ACTA	4	44363	44378	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016389	ATTT	3	45344	45356	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016389	CT	6	45802	45812	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016389	CAA	4	47244	47255	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016389	TATT	3	47615	47626	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016389	AAG	4	48007	48017	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016389	AAAT	3	48740	48752	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016389	AT	6	49734	49744	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016389	CTTT	3	50785	50795	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016389	CTT	4	52185	52195	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016389	TA	6	52225	52235	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016389	TA	6	52355	52365	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016389	T	16	52625	52640	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016389	CAG	4	53732	53743	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016389	AT	6	54391	54401	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016389	GACAA	3	54569	54583	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016389	TAA	4	55342	55352	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016389	CTT	4	55741	55752	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016389	TA	6	56078	56088	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016389	A	13	56197	56209	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016389	AAGA	3	57495	57506	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016389	TTCA	3	57996	58007	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016389	CAT	4	58366	58377	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016389	AATG	3	58585	58596	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016389	AAGA	3	60102	60112	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016389	AATAG	3	60213	60226	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016389	AGC	4	61208	61218	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016389	T	17	61613	61629	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_016389	CTTTT	3	62373	62386	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016389	TTTG	3	62544	62554	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016389	AAT	4	63073	63086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016389	CTC	4	64157	64168	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016389	GAAA	3	64963	64974	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016389	GAA	4	65720	65731	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016389	T	12	65993	66004	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016389	CAA	4	67400	67411	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016389	AGAT	3	67475	67486	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016389	TC	6	69644	69654	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016389	ACGT	3	71918	71928	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016389	ATC	6	72106	72124	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
104	NC_016389	AATT	3	72384	72394	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016389	A	13	74512	74524	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016389	AG	6	75249	75259	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016389	AGTTGG	3	75331	75347	17	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016389	TAGT	3	76554	76565	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016389	TA	6	76858	76869	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016389	ATC	4	77086	77097	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016389	CTTCT	3	77184	77197	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016389	ATTT	3	77544	77555	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016389	TAGCT	3	80442	80456	15	20 %	40 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016389	AT	6	80695	80705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016389	GGAT	3	81113	81124	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016389	GTGG	3	81254	81265	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016389	AGC	4	82655	82666	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016389	CT	6	83532	83543	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016389	A	12	84101	84112	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016389	TTGA	3	85074	85085	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016389	GCCAC	3	85574	85587	14	20 %	0 %	20 %	60 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016389	TCGT	3	86094	86105	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016389	TA	6	86463	86474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016389	GAAA	3	87497	87507	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016389	A	17	87830	87846	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016389	TTCT	3	88647	88657	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016389	CTAA	3	89176	89186	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016389	AAAG	3	89651	89662	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016389	ATTCTC	3	90435	90452	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
130	NC_016389	TTAA	3	90728	90738	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016389	ATTTTT	3	92319	92336	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
132	NC_016389	TTCT	3	92865	92876	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016389	TAAG	3	94752	94763	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016389	TAC	4	94918	94929	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016389	AGA	4	95599	95609	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016389	GAA	5	95982	95997	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016389	CTT	4	96948	96959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016389	CCTTT	3	98772	98786	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016389	TATAA	3	99790	99804	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016389	TAG	4	99857	99867	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 21