ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 51

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016388	CTT	4	195	207	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016388	GAAAA	3	261	276	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016388	AAG	4	1190	1201	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016388	AAAC	3	2537	2548	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016388	AGGT	3	3003	3013	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016388	CTA	4	3699	3709	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016388	TATGG	3	3959	3972	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016388	TCTT	3	5082	5092	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016388	CTT	4	5143	5154	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016388	AAG	4	5289	5300	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016388	CTTG	3	6645	6656	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016388	ATT	4	7269	7279	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016388	AGA	5	8826	8839	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016388	AAGA	4	9191	9206	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016388	TA	6	9276	9288	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016388	AAAG	3	10098	10108	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016388	AGTTA	3	10387	10400	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016388	TGA	4	11175	11186	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016388	TA	7	11447	11459	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016388	CTT	4	11987	11998	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016388	CGTT	3	12582	12593	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016388	GTA	4	12789	12799	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016388	ACTT	3	12875	12885	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016388	TAG	4	14696	14706	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016388	TCT	4	14707	14718	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016388	TA	7	14755	14767	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016388	AGAA	3	15064	15075	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016388	TA	6	15724	15734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016388	CTTT	3	17295	17307	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016388	GTAT	3	17637	17647	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016388	ATA	4	17745	17755	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016388	CTCG	3	17796	17806	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016388	ATA	5	18120	18134	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016388	GTGA	3	19397	19408	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016388	AAT	4	20031	20041	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016388	AAGG	3	21074	21085	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016388	GAA	4	21099	21111	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016388	CTT	4	22912	22922	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016388	TAAC	3	23206	23217	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016388	AAG	4	23756	23767	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016388	TA	15	24181	24212	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016388	TAT	4	24802	24812	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016388	A	16	25039	25054	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016388	AACA	3	25123	25134	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016388	CT	7	25455	25468	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016388	GAA	4	25522	25533	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016388	AAC	4	26452	26462	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016388	CTTT	4	27194	27209	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016388	AAAGT	3	27745	27758	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016388	CTA	4	27904	27915	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016388	AT	6	29969	29980	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016388	TTAC	3	30005	30016	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016388	AGC	4	30344	30355	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016388	TGG	4	31283	31294	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016388	CTT	4	33037	33048	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016388	CTT	4	33783	33793	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016388	CGA	4	33909	33920	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016388	TACA	3	34414	34425	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016388	TA	7	34486	34498	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016388	AAG	4	34498	34510	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016388	AG	6	35366	35376	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016388	TTTC	3	36256	36267	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016388	AAGA	3	37375	37386	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016388	ATC	4	37604	37616	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016388	ATT	4	37670	37681	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016388	ATA	4	38494	38505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016388	AGA	4	38921	38932	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016388	GAA	4	39112	39123	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016388	AATT	3	42155	42166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016388	ATA	4	42492	42503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016388	CAT	4	43024	43034	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016388	A	15	43236	43250	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016388	TAAA	3	43347	43358	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016388	GAG	4	46259	46271	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016388	CTTT	3	46776	46786	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016388	GCTT	3	46814	46825	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016388	TCAA	3	47965	47975	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016388	AGTC	3	49515	49525	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016388	AAG	4	49677	49688	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016388	TCTTTA	3	50118	50135	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016388	ATAG	3	50799	50809	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016388	TTAG	3	51261	51272	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016388	ATA	4	51471	51482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016388	TTC	4	52317	52328	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016388	A	14	52965	52978	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016388	ATCTAA	3	53392	53409	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016388	GAAA	3	53888	53898	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016388	TTTC	3	54200	54211	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016388	TGC	4	54215	54226	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016388	GAT	4	54389	54400	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016388	TTCTAA	3	55549	55567	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
92	NC_016388	TGGC	3	56186	56196	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016388	AAAG	4	56541	56556	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016388	CTTA	3	56606	56617	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016388	ATGC	3	57530	57541	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016388	ACTT	3	59610	59621	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016388	CTT	4	60247	60257	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016388	AGAA	4	60723	60737	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016388	CATTG	3	61615	61629	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016388	GGGC	3	61710	61720	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016388	GAG	4	61905	61916	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016388	AAAG	3	62157	62168	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016388	T	12	63125	63136	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016388	AAATT	3	64661	64676	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016388	TCT	4	64959	64970	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016388	TGC	4	66095	66106	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016388	GGATA	3	66373	66386	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016388	CAG	4	66637	66649	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016388	A	13	67585	67597	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016388	TC	6	68177	68188	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016388	A	13	68693	68705	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016388	GAA	4	68700	68711	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016388	TGACT	3	68895	68909	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016388	CT	6	69400	69411	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016388	TTA	4	71408	71419	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016388	AGC	4	71911	71922	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016388	CTTA	3	72473	72484	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016388	TCTTT	3	73208	73222	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016388	GCA	4	73333	73344	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016388	CCAAG	3	73526	73539	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016388	TGGC	3	74299	74310	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016388	TCAA	3	74594	74604	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016388	CCAA	3	75344	75355	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016388	TAT	4	75702	75712	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016388	T	14	75817	75830	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016388	T	14	76694	76707	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016388	TAAG	3	76843	76853	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016388	AAG	4	78908	78919	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016388	CTTTA	3	79287	79302	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
130	NC_016388	GA	6	79440	79450	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016388	TAGA	3	80544	80555	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016388	CCGA	3	80569	80580	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016388	AGAA	3	80844	80856	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016388	GAAG	3	81795	81806	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016388	TAA	4	82407	82417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016388	TA	7	83193	83205	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016388	AAGA	3	83287	83299	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016388	TCA	4	83413	83423	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016388	AGAA	4	86157	86173	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016388	CTTT	3	86964	86975	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016388	CTG	4	87805	87815	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016388	A	13	88916	88928	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016388	T	18	89624	89641	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016388	TA	6	89712	89722	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016388	TTGC	3	89778	89788	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016388	GTTA	3	89802	89812	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016388	TA	8	90217	90231	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016388	AAGA	3	90714	90726	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016388	TAG	4	90742	90752	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016388	TTCT	3	91557	91567	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 51