ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 44

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016387	AAAGT	3	807	821	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016387	ATG	4	1665	1676	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016387	GAAG	3	2420	2432	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016387	GTA	4	3460	3470	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016387	TA	7	3619	3632	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016387	AT	6	3670	3680	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016387	TGGT	3	3713	3724	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016387	AGCG	3	4981	4991	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016387	TAGA	3	5537	5549	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016387	AT	6	5736	5746	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016387	CCAAG	3	6219	6233	15	40 %	0 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016387	A	13	6547	6559	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016387	TAT	4	6779	6790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016387	ACTT	3	7497	7507	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016387	AAG	4	7776	7787	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016387	AT	6	8720	8730	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016387	AGAA	3	8751	8762	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016387	AGCT	3	10148	10158	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016387	AAAG	3	11400	11411	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016387	GAC	4	12064	12074	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016387	AT	6	13191	13201	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016387	AAAG	3	14147	14157	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016387	ATATA	3	14594	14608	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016387	TAAG	3	14847	14859	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016387	CAT	4	15874	15885	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016387	CGTT	3	16580	16591	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016387	TA	6	17031	17041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016387	ATA	4	17107	17118	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016387	TTCC	3	17243	17254	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016387	T	15	17418	17432	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016387	CTTT	3	17476	17487	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016387	TCT	4	18307	18319	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016387	TTGC	3	18505	18516	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016387	AG	6	19595	19605	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016387	T	12	19716	19727	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016387	TAGGA	3	20694	20708	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016387	AAG	4	21520	21531	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016387	GAT	4	22492	22503	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016387	AAG	4	23098	23109	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016387	AAAG	3	23427	23437	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016387	TTC	4	23682	23692	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016387	AAAG	3	23940	23950	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016387	CAG	4	25715	25726	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016387	TTTG	3	25843	25853	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016387	AATAA	3	26887	26900	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016387	CTATA	3	28188	28203	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016387	AAG	4	28287	28299	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016387	GATC	3	28821	28831	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016387	GCTT	3	29384	29394	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016387	GTTTT	3	30050	30064	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016387	TTA	4	30211	30222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016387	T	13	32260	32272	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016387	CAAA	3	32982	32992	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016387	TTA	4	33243	33255	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016387	TAT	4	33325	33336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016387	CT	6	33741	33751	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016387	CTT	4	34244	34255	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016387	TAATA	3	34353	34366	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016387	TTA	4	34464	34474	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016387	GTCT	3	34689	34701	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016387	TTTTTA	3	35480	35497	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016387	AAG	4	36076	36090	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016387	TCCT	3	36179	36189	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016387	A	16	36262	36277	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016387	AGAA	3	36393	36405	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016387	ACAT	3	36912	36923	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016387	TGC	4	37562	37573	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016387	ATA	5	37875	37890	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016387	TGAA	3	38284	38295	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016387	ATT	4	38461	38471	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016387	TCG	4	38682	38693	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016387	TA	6	44088	44099	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016387	AAT	4	44258	44268	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016387	TCT	4	44569	44579	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016387	CTCA	3	44973	44984	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016387	ATA	8	45020	45042	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016387	AAG	4	45347	45358	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016387	CCT	4	45489	45499	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016387	GAAA	3	45567	45577	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016387	A	12	46539	46550	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016387	A	14	46807	46820	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016387	TAA	4	47974	47985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016387	A	16	48568	48583	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016387	ATCT	3	49144	49155	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016387	TTC	4	49649	49660	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016387	TC	11	49666	49686	21	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016387	CTTTTT	3	50325	50342	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
88	NC_016387	AAGA	3	50524	50535	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016387	TA	6	50907	50918	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016387	TAA	4	51933	51943	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016387	A	13	52086	52098	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016387	CAAG	3	52112	52123	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016387	ACT	4	52266	52278	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016387	CATGA	3	53134	53148	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016387	TAA	5	53171	53184	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016387	AGGA	3	53588	53599	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016387	GA	6	53989	53999	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016387	TTA	4	54098	54109	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016387	A	18	54899	54916	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016387	TA	6	55275	55285	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016387	ATC	4	56323	56334	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016387	AAAT	3	56628	56638	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016387	TAAAAC	3	57905	57922	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
104	NC_016387	TCT	4	58033	58044	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016387	AAGG	3	58844	58854	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016387	AAAG	3	59033	59044	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016387	CTA	4	59338	59349	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016387	AG	6	59396	59406	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016387	CCTT	3	59461	59473	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016387	GTGC	3	60941	60951	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016387	ATTA	3	61379	61390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016387	CAA	4	61446	61457	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016387	ATA	4	62396	62407	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016387	TACT	3	63009	63020	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016387	TAT	4	63160	63170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016387	AAAG	3	63671	63682	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016387	TTC	4	63983	63995	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016387	ATTATA	3	65034	65051	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_016387	TA	6	65050	65060	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016387	TAT	5	66652	66666	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016387	CTTT	3	66884	66896	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016387	T	12	67027	67038	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016387	AGA	4	67864	67876	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016387	TC	7	69957	69970	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016387	GA	6	70910	70920	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016387	GA	6	72344	72355	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016387	ATA	5	72722	72735	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016387	AAGT	3	73527	73539	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016387	GTAGG	3	74647	74660	14	20 %	20 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016387	AGA	4	74666	74676	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016387	AGC	4	75024	75034	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016387	CCAA	3	76245	76255	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016387	T	12	76447	76458	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016387	CTTT	3	76463	76473	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016387	A	19	77630	77648	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
136	NC_016387	A	14	78683	78696	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016387	CAGTAG	3	79117	79133	17	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
138	NC_016387	TCAA	3	79356	79367	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016387	TAA	4	79383	79394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016387	A	12	80492	80503	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016387	GTA	4	83698	83708	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 44