ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 55

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016385	TAA	4	1106	1117	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016385	CTA	4	2124	2134	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016385	AAG	4	3746	3757	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016385	TCT	5	4813	4827	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016385	CTT	4	11428	11439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016385	AAG	4	12676	12687	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016385	AGA	4	13396	13408	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016385	ATT	4	16447	16457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016385	AGA	4	19686	19696	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016385	AAG	4	24729	24739	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016385	TAA	4	25329	25340	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016385	AAG	4	35599	35610	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016385	TCT	4	35726	35736	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016385	AAG	4	36098	36110	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016385	CAT	4	38115	38125	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016385	TCT	4	38625	38636	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016385	GAA	4	42683	42694	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016385	TCT	4	43262	43273	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016385	TCT	4	44039	44051	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016385	GAA	4	44295	44306	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016385	CTT	4	44769	44779	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016385	GCA	4	45962	45974	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016385	AGC	4	46286	46297	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016385	CTT	5	46874	46888	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016385	GGT	4	47218	47229	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016385	AGA	4	47419	47432	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016385	GCT	4	49780	49791	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016385	TAT	4	51440	51451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016385	TAA	4	53036	53046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016385	TAC	4	56241	56252	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016385	CTG	4	56920	56931	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016385	TCT	4	57987	57998	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016385	GAT	4	61222	61232	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016385	ATA	5	64122	64135	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016385	TAT	4	65918	65928	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016385	TAA	4	70407	70418	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016385	CTT	6	70593	70611	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
38	NC_016385	CTT	4	72983	72993	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016385	TTC	5	76094	76107	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016385	AGA	4	76665	76676	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016385	AAC	4	77059	77070	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016385	TTC	5	78138	78151	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016385	GAT	4	80955	80966	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016385	CAT	4	81248	81258	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016385	AGT	4	82005	82016	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 55