ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 55

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016385	TAAG	3	533	543	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016385	TAA	4	1106	1117	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016385	TCTAT	3	1418	1431	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016385	CTA	4	2124	2134	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016385	AAG	4	3746	3757	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016385	TTTC	3	3774	3786	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016385	TCT	5	4813	4827	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016385	AG	6	9797	9808	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016385	TTAA	3	10965	10976	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016385	GATAG	3	11075	11088	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016385	T	14	11139	11152	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016385	CTT	4	11428	11439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016385	AAG	4	12676	12687	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016385	AGA	4	13396	13408	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016385	TTTA	3	15693	15705	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016385	TCAC	3	15936	15946	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016385	ATT	4	16447	16457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016385	A	14	17436	17449	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016385	AGTA	3	17620	17630	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016385	AGA	4	19686	19696	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016385	T	16	20488	20503	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016385	ACTATG	3	21258	21274	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
23	NC_016385	AGTCC	3	22109	22124	16	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016385	TTCA	3	22386	22397	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016385	TTTG	3	22896	22906	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016385	TAAG	3	24342	24353	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016385	AAG	4	24729	24739	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016385	TAA	4	25329	25340	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016385	GAAA	3	26307	26318	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016385	AGTT	3	29810	29820	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016385	TTTC	3	31356	31366	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016385	T	12	32317	32328	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016385	CTTT	3	33471	33481	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016385	ATGC	3	33984	33995	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016385	TAAGTC	3	34109	34125	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016385	AAAG	3	34495	34505	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016385	AGAA	3	35517	35528	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016385	AAG	4	35599	35610	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016385	TCT	4	35726	35736	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016385	AAG	4	36098	36110	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016385	TAAA	3	36866	36877	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35805108
42	NC_016385	T	12	36915	36926	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016385	TTTA	3	37495	37505	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016385	CAT	4	38115	38125	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016385	TCT	4	38625	38636	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016385	CTTT	3	39225	39236	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016385	A	16	39801	39816	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016385	AG	11	41441	41461	21	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016385	CTGAT	3	42562	42575	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016385	GAA	4	42683	42694	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016385	TCT	4	43262	43273	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016385	TCT	4	44039	44051	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016385	GCTT	3	44052	44062	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016385	GAA	4	44295	44306	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016385	CCTT	3	44409	44419	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016385	CTT	4	44769	44779	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016385	CT	6	44929	44939	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016385	ATTC	3	45165	45176	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016385	TTTC	3	45688	45699	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016385	GCA	4	45962	45974	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016385	AGC	4	46286	46297	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016385	CTT	5	46874	46888	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016385	GGT	4	47218	47229	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016385	AGA	4	47419	47432	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016385	TA	6	47614	47624	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016385	TCTAA	3	47801	47815	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016385	GTTA	3	47862	47873	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016385	GCT	4	49780	49791	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016385	CTAG	3	50448	50458	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016385	TAT	4	51440	51451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016385	GATC	3	51598	51609	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016385	TAA	4	53036	53046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016385	GAAA	3	53324	53334	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016385	TTCTT	3	54030	54043	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016385	AAGA	3	54479	54491	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016385	AACA	3	55982	55992	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016385	CTTT	3	56212	56222	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016385	TAC	4	56241	56252	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016385	T	18	56675	56692	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016385	CTG	4	56920	56931	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016385	TCT	4	57987	57998	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016385	TA	6	59340	59350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016385	AATA	3	60570	60580	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016385	CTTT	3	61023	61034	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016385	TA	6	61211	61221	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016385	GAT	4	61222	61232	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016385	TGCT	3	61765	61777	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016385	TA	7	62998	63010	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016385	ATA	5	64122	64135	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016385	GCTC	3	64517	64528	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016385	TA	7	64626	64640	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016385	AAAG	3	65448	65458	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016385	AT	7	65637	65649	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016385	TAT	4	65918	65928	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016385	CTTT	3	68206	68216	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016385	T	15	68445	68459	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016385	CTTT	3	68666	68676	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016385	GGTAA	3	68692	68705	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016385	CTTAG	3	70301	70314	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016385	TAA	4	70407	70418	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016385	A	13	70496	70508	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016385	CTT	6	70593	70611	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
103	NC_016385	AT	6	72195	72205	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016385	CTT	4	72983	72993	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016385	TTC	5	76094	76107	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016385	A	16	76277	76292	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016385	AGA	4	76665	76676	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016385	AAC	4	77059	77070	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016385	AAGT	3	77946	77957	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016385	TTC	5	78138	78151	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016385	TTCT	3	78242	78252	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016385	GTTG	3	78781	78791	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016385	GAT	4	80955	80966	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016385	CAT	4	81248	81258	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016385	TTAA	3	81614	81624	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016385	GAAA	4	81690	81705	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016385	AGT	4	82005	82016	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016385	GGAA	3	83575	83587	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016385	ACTT	3	83818	83828	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016385	A	15	84269	84283	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016385	A	12	84962	84973	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016385	TATCT	3	85227	85240	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

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