ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 15

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016384	AAAG	3	183	194	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016384	TTTC	3	1813	1823	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016384	GA	6	1862	1873	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016384	CAAG	3	2003	2013	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016384	AG	6	3385	3395	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016384	AGAAA	3	3874	3888	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016384	TAA	5	4903	4917	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016384	GTT	4	5018	5029	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016384	CTTC	3	5445	5456	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016384	CCTT	3	6008	6018	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016384	ATCC	3	6456	6467	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016384	GTAA	3	6572	6583	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016384	AG	6	8473	8484	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016384	AAGG	3	8598	8609	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016384	AAAAG	3	9515	9528	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016384	TAAA	3	10695	10705	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016384	TCT	4	10894	10904	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016384	TA	6	11100	11110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016384	A	12	11324	11335	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016384	GAA	4	11950	11960	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016384	CTA	4	12790	12801	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016384	AAAT	3	13012	13023	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016384	TCAA	3	13142	13153	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016384	TA	6	13639	13649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016384	TCTT	3	13903	13913	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016384	AGAAAA	3	14023	14040	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_016384	GAAA	3	15202	15214	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016384	AGTCA	3	15312	15326	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016384	CAC	4	17449	17459	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016384	TA	6	17634	17644	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016384	CTATT	3	17890	17905	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016384	AGTA	3	18005	18016	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016384	ATTT	3	18685	18695	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016384	TTC	4	18944	18954	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016384	TA	7	19583	19595	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016384	ATA	6	19643	19660	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_016384	GTTGG	3	20116	20130	15	0 %	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016384	TCT	4	22579	22593	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016384	G	15	24564	24578	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016384	AGGA	3	24832	24842	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016384	ATA	4	25763	25773	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016384	TA	6	25899	25910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016384	TA	6	26031	26041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016384	ATC	4	27581	27592	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016384	TA	6	29075	29085	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016384	AGA	4	29176	29188	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016384	TTTC	3	29539	29549	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016384	CTTT	3	30735	30745	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016384	GAT	4	31302	31313	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016384	TCATT	3	35139	35152	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016384	TTGC	3	35329	35339	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016384	TTTA	3	37248	37258	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016384	TTGA	3	39369	39379	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016384	AAG	4	39613	39623	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016384	TAA	4	40971	40982	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016384	AT	6	41403	41414	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016384	GTAA	3	42406	42417	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016384	AGT	4	42530	42541	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016384	GTAA	4	43122	43137	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016384	TAG	4	43432	43442	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016384	ATG	4	43877	43888	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016384	ATTCTT	3	44193	44209	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
63	NC_016384	GGTA	3	44719	44729	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016384	CTA	4	44836	44848	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016384	TTAAG	3	45196	45210	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016384	TCT	5	46185	46199	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016384	GCT	4	46474	46484	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016384	TCT	4	46780	46790	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016384	GT	6	46948	46958	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016384	CTCCTT	3	47135	47152	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
71	NC_016384	CTA	4	47150	47164	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016384	TGA	4	47189	47199	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016384	TTGG	3	48268	48279	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016384	ATTTC	3	48364	48378	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016384	TTC	4	48512	48522	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016384	AAAG	3	48588	48598	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016384	TTTC	3	48714	48725	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016384	CCTA	3	48762	48773	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016384	GCTT	3	48808	48818	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016384	TATT	3	48902	48913	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016384	CTT	4	49464	49475	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016384	TA	6	49764	49775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016384	TATG	3	50210	50221	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016384	GTA	4	51459	51469	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016384	TA	6	51567	51577	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016384	ATAC	3	52423	52433	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016384	TA	6	52441	52451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016384	TCGC	4	53362	53377	16	0 %	25 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016384	TAT	4	54462	54474	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016384	TCCA	3	55381	55392	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016384	TTGT	3	55956	55966	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016384	TAG	4	56352	56363	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016384	AG	6	56553	56563	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016384	ACTTAT	3	56641	56657	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
95	NC_016384	TATAA	3	56794	56808	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016384	TTAA	3	57889	57901	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016384	TA	7	58839	58851	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016384	A	15	59927	59941	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016384	TCAA	3	60918	60929	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016384	TCT	4	63596	63606	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016384	GAAA	3	63623	63635	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016384	TGA	4	64260	64270	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016384	GGAA	3	65204	65215	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016384	GA	6	68096	68106	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016384	AGAA	4	69279	69294	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016384	CTT	4	69794	69805	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016384	TTTTAA	3	70423	70439	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016384	AGT	4	71675	71686	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016384	TCCT	3	71780	71791	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016384	AAG	6	72697	72714	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016384	TA	7	73755	73767	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016384	TTTC	3	74484	74495	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016384	ATC	4	75450	75461	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016384	TAGA	3	75697	75707	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016384	A	14	75712	75725	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016384	TAA	4	77094	77105	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016384	TTTG	3	77344	77355	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016384	TTCT	3	77955	77966	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016384	AAG	4	78234	78246	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016384	AAT	4	78728	78738	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016384	AGA	4	79355	79369	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016384	CTTG	3	79896	79906	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016384	AGAA	3	80271	80282	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016384	CTAT	3	80583	80594	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016384	TAAA	3	80780	80791	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016384	TCTTAT	4	81122	81143	22	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016384	TAGG	3	81619	81630	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016384	TTAC	3	83084	83094	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016384	TAA	4	84011	84022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016384	TGTA	3	84097	84109	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016384	TTA	4	84141	84151	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016384	TCT	4	84908	84918	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016384	GAAA	3	85026	85036	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016384	AGA	5	85253	85266	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016384	AGGG	3	85289	85299	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016384	TAAGT	3	85323	85336	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016384	A	12	85954	85965	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016384	TTTA	3	86068	86078	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016384	AATC	3	86518	86529	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016384	CTTT	3	86579	86589	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016384	AGA	4	86932	86942	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016384	CCCT	5	87721	87740	20	0 %	25 %	0 %	75 %	10 %	Non-Coding
143	NC_016384	TTCTTT	3	88345	88362	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
144	NC_016384	CAAT	3	89263	89274	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016384	CTT	4	89478	89489	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016384	CTTT	4	89687	89702	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_016384	ACAAAT	3	91357	91375	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
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158	NC_016384	CGAG	3	98284	98294	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
159	NC_016384	CAGTAT	3	98411	98428	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
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167	NC_016384	TAGA	3	102970	102980	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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173	NC_016384	ATCT	3	109007	109017	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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178	NC_016384	TTCT	3	112078	112089	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
179	NC_016384	TCTT	4	113506	113522	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
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181	NC_016384	ATGA	3	114679	114691	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
182	NC_016384	TTTC	4	114692	114706	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
183	NC_016384	AAGC	3	116209	116219	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
184	NC_016384	GAAA	3	116438	116448	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
185	NC_016384	CCTT	3	116509	116519	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
186	NC_016384	TTCT	3	116651	116661	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
187	NC_016384	CT	6	118067	118077	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
188	NC_016384	CTC	4	118209	118220	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
189	NC_016384	CCTTT	3	118469	118483	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
190	NC_016384	AGCC	3	119257	119268	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
191	NC_016384	AAGCA	3	119302	119316	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
192	NC_016384	AAG	4	119688	119700	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
193	NC_016384	CTTA	3	119812	119823	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
194	NC_016384	AT	6	120713	120723	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
195	NC_016384	AATT	3	121857	121868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
196	NC_016384	AAGA	3	123021	123032	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016384	GTAA	3	123125	123135	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
198	NC_016384	GCTT	3	123147	123158	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
199	NC_016384	TAGC	3	123469	123480	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_016384	AG	6	123494	123504	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
201	NC_016384	CTTT	4	123847	123861	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
202	NC_016384	AAAT	3	124182	124193	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
203	NC_016384	TTTA	3	124197	124209	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
204	NC_016384	AGAC	3	124211	124221	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
205	NC_016384	TA	6	124855	124865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
206	NC_016384	AAGA	3	124947	124958	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
207	NC_016384	ACCT	3	125001	125012	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
208	NC_016384	ATTT	3	125118	125128	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
209	NC_016384	GAA	4	125164	125174	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
210	NC_016384	ACTG	3	127812	127824	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 15