ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 26

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016383	TGCA	3	537	547	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016383	TA	6	1119	1130	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016383	AT	6	1833	1844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016383	TAT	4	2097	2107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016383	TTAC	3	2146	2158	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016383	A	12	2912	2923	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016383	AGAA	3	4053	4064	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016383	TA	6	4090	4100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016383	CTTA	3	4317	4328	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016383	TA	6	5044	5055	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016383	AAAG	3	6360	6370	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016383	T	12	6863	6874	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016383	TCCT	3	6882	6892	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016383	AAAAAG	3	7059	7077	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_016383	GAAA	3	8001	8012	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016383	GTCA	3	8755	8766	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016383	CTTT	3	9107	9119	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016383	TCTCT	3	9509	9522	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016383	AGA	4	10579	10589	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016383	TAAAGG	3	10659	10675	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016383	GA	6	11644	11654	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016383	GACA	3	13925	13935	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016383	CTAA	3	13943	13953	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016383	AT	8	14482	14496	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016383	AAAG	3	15013	15024	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016383	CTTT	3	15599	15610	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016383	TAAG	3	15984	15994	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016383	CAAAGA	3	16453	16469	17	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016383	ACA	4	16648	16659	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016383	TCTTA	3	18153	18167	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016383	TATT	3	19979	19990	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016383	AG	7	20052	20065	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016383	ACTTT	3	20354	20368	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016383	CTTTT	3	21292	21306	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016383	T	12	21464	21475	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016383	ATC	4	22303	22315	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016383	CTTT	3	24687	24697	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016383	AT	6	25678	25688	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016383	ATTG	3	26933	26943	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016383	GAAA	3	27558	27569	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016383	AAAG	3	28997	29008	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016383	AGCG	3	29530	29540	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016383	AAAAG	3	30410	30423	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016383	TA	6	31593	31603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016383	CTAA	4	31683	31698	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016383	ATTAAA	3	32095	32111	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016383	ATCG	3	32175	32185	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016383	T	14	32304	32317	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016383	CAAG	3	32498	32508	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016383	GAAA	4	34929	34945	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016383	AAGA	3	34949	34960	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016383	CTCTG	3	35363	35376	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016383	GAAA	5	36026	36045	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_016383	TCAAG	4	36381	36400	20	40 %	20 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
55	NC_016383	A	16	36773	36788	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016383	AATTA	4	36829	36847	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_016383	AGA	4	37438	37449	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016383	T	14	38263	38276	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016383	AAAG	4	38716	38731	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016383	T	14	39069	39082	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016383	CTT	4	39263	39275	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016383	A	13	39688	39700	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016383	TCT	4	41774	41785	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016383	TA	7	41967	41979	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016383	TTTC	4	42474	42488	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016383	ATA	4	43228	43240	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016383	CAAG	3	44805	44815	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016383	TTGG	3	45326	45337	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016383	CTT	5	45814	45827	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016383	CCTT	3	45897	45909	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016383	TA	6	46184	46194	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016383	TA	6	46656	46667	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016383	TTATAA	3	46741	46757	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016383	TAACA	3	47303	47316	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016383	AGA	4	47596	47607	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016383	AAT	4	47762	47773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016383	TGTTAT	3	48795	48811	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_016383	CGTT	3	48936	48947	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016383	CAT	4	49987	49997	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016383	CT	6	50575	50585	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016383	GTAA	3	51647	51658	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016383	CTTTCT	3	52526	52542	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016383	CCAG	3	53584	53594	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016383	A	14	53680	53693	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016383	AT	7	54157	54169	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016383	ACA	4	54427	54437	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016383	TA	7	54717	54729	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016383	CTA	4	54841	54851	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016383	AGC	4	54904	54914	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016383	GAAA	3	55907	55917	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016383	AAAAGA	3	55942	55960	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_016383	AAAGC	4	56218	56236	19	60 %	0 %	20 %	20 %	5 %	Non-Coding
93	NC_016383	A	14	56275	56288	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016383	AAC	4	58967	58977	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016383	ATAA	4	60915	60930	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016383	AGT	4	61613	61623	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016383	TGCCAA	3	62475	62492	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016383	CCA	4	62558	62569	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016383	AGA	4	62827	62838	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016383	GGAAAT	3	64078	64096	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_016383	CTT	5	64494	64508	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016383	TTTC	3	64566	64577	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016383	ATA	4	66074	66085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016383	ACA	4	66107	66117	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016383	TTTC	3	66904	66915	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016383	CTTT	3	66998	67008	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016383	TA	6	67387	67399	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016383	AGAAA	3	67603	67618	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016383	CTAAGG	3	67641	67657	17	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016383	TATT	3	67728	67738	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016383	CT	6	67966	67977	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016383	AGAA	3	69022	69034	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016383	CTTT	3	69853	69864	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016383	AAAC	3	70066	70077	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016383	CAAAA	3	71788	71802	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016383	AAAG	3	72563	72574	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016383	TTTAC	3	72614	72628	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016383	GTCA	3	72728	72740	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016383	A	13	72936	72948	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016383	CTAAG	3	73969	73984	16	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016383	GAAT	3	74148	74160	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016383	GA	6	75425	75436	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016383	AGAA	3	76675	76685	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016383	TTTC	3	76782	76793	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016383	GTCAA	3	77836	77849	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016383	TAC	4	77993	78003	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016383	TAAGTA	3	78119	78135	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_016383	AAG	4	78499	78510	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016383	AAT	4	78702	78713	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016383	GAGAA	3	78718	78731	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016383	AGC	4	79583	79594	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016383	A	13	79862	79874	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016383	TCA	4	80353	80363	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016383	ATT	4	81769	81779	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016383	AAAG	3	82017	82028	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016383	AAAG	3	84006	84016	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016383	ATC	4	84085	84096	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016383	CTT	4	84208	84220	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016383	TA	6	84326	84336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016383	TTTGA	3	84501	84514	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016383	TA	6	85503	85513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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181	NC_016383	AAAG	3	113468	113478	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
182	NC_016383	AAAG	5	113570	113590	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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184	NC_016383	TCT	4	114418	114429	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 26