ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 9

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016382	AAG	4	1633	1644	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016382	TGC	4	3776	3788	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016382	GCT	4	4180	4191	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016382	ATT	5	6503	6517	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016382	GAA	4	9042	9053	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016382	ATA	4	9492	9503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016382	ATC	4	9820	9831	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016382	CAC	4	10973	10984	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016382	CTA	4	11096	11106	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016382	CAT	4	12048	12059	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016382	CTA	5	18336	18349	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016382	CAC	4	18710	18721	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016382	AAG	4	19233	19243	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016382	AGT	4	19765	19777	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016382	AAG	4	20181	20192	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016382	TAG	4	23497	23508	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016382	CTT	4	31700	31710	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016382	ATC	4	34453	34463	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016382	TAT	4	41777	41787	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016382	AGA	4	42737	42749	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016382	TCT	4	44317	44329	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016382	AAT	4	45754	45764	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016382	CAT	4	45831	45841	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016382	TAA	4	49570	49581	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016382	TAA	4	51188	51198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016382	CTG	4	52885	52896	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016382	AGA	4	55520	55532	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016382	GCT	4	57772	57783	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016382	CTC	4	57884	57894	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016382	TAG	4	61370	61381	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016382	TAG	5	61754	61768	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016382	TCT	4	61923	61934	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016382	GAT	4	66811	66822	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016382	CTT	4	67525	67535	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016382	TCT	4	68694	68705	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016382	AGT	4	73048	73059	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016382	ATT	4	74052	74063	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016382	AGT	4	75374	75384	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016382	AAG	4	78448	78459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016382	ATT	4	78674	78685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016382	CTA	5	79933	79947	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016382	TTC	4	83606	83617	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016382	ACT	4	87830	87841	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016382	AGA	4	87979	87989	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016382	TCT	4	88591	88602	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016382	TAG	4	89119	89129	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016382	GAA	4	89536	89547	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016382	CTT	4	90901	90912	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016382	GAA	4	92323	92333	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016382	TTA	6	94469	94486	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016382	CTT	4	95853	95864	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016382	AAC	4	102393	102404	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016382	AAT	4	106747	106758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016382	ATA	4	112363	112373	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016382	TCT	4	112568	112578	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016382	GAA	4	113279	113289	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016382	CTT	4	113680	113690	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35805108
58	NC_016382	CAC	4	115999	116010	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016382	TAT	5	116914	116927	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016382	ATG	4	117228	117239	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016382	TTG	4	117547	117558	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016382	AGT	4	117761	117772	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016382	TCT	4	119710	119720	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016382	AAG	4	120148	120159	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016382	TTC	4	120457	120467	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016382	ACG	4	121974	121984	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016382	ACT	4	122188	122198	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016382	GAT	4	128700	128711	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016382	GAA	4	132820	132830	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016382	ATA	4	135030	135042	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016382	TCA	5	135957	135970	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016382	CCA	4	141157	141168	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 9