ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 7

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016381	T	12	856	867	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016381	AG	6	1217	1227	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016381	T	12	3391	3402	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016381	ACT	4	3653	3663	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016381	GAAA	4	5543	5557	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016381	AAAG	3	6358	6368	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016381	AG	6	6964	6975	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016381	CTGG	3	7053	7064	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016381	GAG	4	7264	7274	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016381	T	12	7361	7372	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016381	CTTA	3	8409	8419	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016381	GTTA	3	8697	8707	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016381	CTAA	3	9814	9824	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016381	TTC	4	10325	10336	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016381	AT	6	12420	12431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016381	TC	6	14429	14439	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016381	T	12	15037	15048	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016381	CCTT	3	15465	15476	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016381	ATCG	3	16186	16197	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016381	TATT	3	16954	16966	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016381	TTCA	3	17917	17928	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016381	CTT	4	18241	18251	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016381	TTTA	3	18445	18455	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016381	GAA	6	18493	18511	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_016381	AAGG	4	19557	19571	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016381	TCT	4	21629	21640	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016381	TA	7	21735	21747	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016381	TAA	4	21946	21956	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016381	CTTT	3	23692	23704	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016381	CCTA	3	24370	24380	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016381	ATA	4	24668	24678	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016381	TAAG	4	24805	24819	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016381	AGCT	3	24899	24910	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016381	TTTC	3	25186	25196	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016381	GTTT	3	25860	25870	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016381	T	13	26881	26893	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016381	TCA	4	28903	28914	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016381	T	17	30300	30316	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016381	CTA	4	31426	31438	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016381	CTTT	3	32408	32419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016381	GCC	4	33115	33125	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016381	TTAT	3	35755	35767	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016381	GCAT	3	36425	36436	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016381	GTA	4	38540	38551	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016381	CTTA	3	39830	39842	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016381	ATA	4	40960	40970	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016381	TTTC	3	41052	41062	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016381	TA	6	41376	41386	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016381	GGAA	3	41567	41578	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016381	TTTG	3	41627	41638	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016381	TTTG	3	41642	41653	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016381	AGGT	3	41760	41771	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016381	CCTT	3	42709	42720	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016381	CAA	4	44400	44411	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016381	AGT	4	44534	44544	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016381	CGCT	4	45432	45447	16	0 %	25 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016381	ATTTC	3	45770	45783	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016381	TCTTT	3	46510	46524	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016381	CCTA	4	46613	46627	15	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016381	AAAG	3	47176	47187	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016381	GTCA	3	50565	50576	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016381	AGA	4	50963	50974	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016381	TA	7	53048	53060	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016381	ATA	5	53091	53105	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016381	GCT	4	53139	53150	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016381	AAGC	3	58188	58198	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016381	ATCT	3	59299	59310	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016381	AAAG	4	59667	59682	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016381	CTTC	3	60297	60308	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016381	CTT	4	61646	61657	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016381	TTC	4	61750	61761	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016381	AAGG	3	62458	62469	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016381	CT	6	63059	63069	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016381	AGTA	3	63739	63750	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016381	AT	6	64033	64043	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016381	TCAC	3	64174	64185	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016381	AT	6	64522	64533	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016381	TAAATA	3	65408	65426	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016381	TAA	4	65493	65503	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016381	A	14	67612	67625	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016381	GATA	3	67832	67843	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016381	AAG	4	67955	67966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016381	AAAG	3	68149	68160	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016381	GTCTAA	3	70046	70064	19	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016381	AT	8	70226	70241	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016381	TTA	4	70273	70284	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016381	T	14	70453	70466	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016381	GAA	4	71031	71041	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35805108
89	NC_016381	TCAA	3	71290	71300	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	35805108
90	NC_016381	GAAA	3	71343	71353	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016381	TTCC	3	71508	71520	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016381	CTT	5	73386	73400	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016381	TTGC	3	74754	74764	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016381	A	16	75797	75812	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016381	TCTT	3	77062	77073	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016381	TAT	4	77151	77162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016381	AGTA	3	77268	77279	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016381	TGAAA	3	77843	77856	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016381	TCT	4	78648	78659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016381	AG	6	79597	79608	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016381	AT	7	80359	80371	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016381	CTTG	3	80534	80545	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016381	TTA	4	80985	80996	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016381	TTAG	3	81150	81161	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016381	AG	6	82496	82506	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016381	T	13	83753	83765	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016381	ACT	4	83806	83816	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016381	TTAC	3	84090	84100	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016381	CTTTT	3	86405	86420	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016381	TA	7	87715	87727	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016381	GAA	4	88327	88337	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016381	ATA	4	88359	88369	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016381	AATT	3	88513	88524	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016381	A	20	88713	88732	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_016381	TAA	4	89953	89964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016381	CCTT	3	90144	90155	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016381	TTAA	3	92779	92790	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016381	AAAG	3	94907	94918	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016381	ATTAGA	3	95102	95120	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
120	NC_016381	AAGG	3	96434	96444	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016381	AAAG	3	97250	97261	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016381	TTTC	3	97612	97623	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016381	AG	6	98068	98078	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016381	TCTAG	3	98775	98789	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016381	TGAG	3	99534	99545	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016381	TA	6	99556	99566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016381	CCCTTC	3	100087	100103	17	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
128	NC_016381	AAAG	3	100482	100493	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016381	GTTCTT	3	102072	102089	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
130	NC_016381	CTTT	3	102608	102619	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016381	AGG	4	103393	103404	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016381	CTTT	3	104494	104504	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016381	A	13	106569	106581	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016381	ATC	4	106776	106787	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016381	A	15	107287	107301	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016381	AAG	4	107698	107709	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016381	TTGG	3	108488	108499	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016381	CTTT	3	108848	108858	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016381	GAT	4	108913	108924	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016381	AGG	4	109180	109191	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016381	GGAATA	3	111921	111938	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_016381	AT	6	112297	112307	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016381	TTC	5	112543	112558	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
144	NC_016381	GA	6	113411	113422	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016381	CCT	4	114233	114243	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016381	A	14	115467	115480	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016381	ATA	4	115677	115687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016381	GCGG	3	117372	117382	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016381	CAAA	3	117771	117781	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016381	TTA	4	118094	118105	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016381	TAAA	3	118333	118344	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016381	TGC	4	118694	118705	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016381	TATAC	3	119400	119415	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
154	NC_016381	TGA	4	119973	119984	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016381	TAA	4	120356	120366	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016381	AAAG	3	120650	120660	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016381	GA	6	120923	120933	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_016381	AT	6	122213	122224	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_016381	TTAG	3	123132	123142	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
160	NC_016381	TAT	4	123814	123825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
161	NC_016381	ATTC	3	125290	125300	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
162	NC_016381	CTT	4	125616	125627	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
163	NC_016381	CCAG	3	126477	126488	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016381	TTC	4	127343	127354	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
165	NC_016381	TCTT	3	128720	128731	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
166	NC_016381	CTT	4	128830	128840	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
167	NC_016381	AG	7	130729	130741	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
168	NC_016381	CTT	4	131593	131604	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
169	NC_016381	A	16	131765	131780	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
170	NC_016381	CTA	4	132054	132064	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
171	NC_016381	AAAGA	3	132602	132616	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
172	NC_016381	CTGC	3	133375	133385	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
173	NC_016381	GGTT	3	133583	133593	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
174	NC_016381	CTT	4	135047	135058	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
175	NC_016381	AAAG	4	136208	136224	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
176	NC_016381	TTA	4	136610	136620	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
177	NC_016381	ACT	4	137038	137048	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
178	NC_016381	TA	7	138394	138408	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
179	NC_016381	AAGT	3	139474	139485	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
180	NC_016381	TGT	4	139770	139781	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
181	NC_016381	ATG	4	141093	141104	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
182	NC_016381	ATT	4	141952	141963	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
183	NC_016381	TG	6	143946	143957	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
184	NC_016381	TTCT	3	144117	144128	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
185	NC_016381	TTA	4	144509	144519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 7