ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 58

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016380CTTG3195206120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
2NC_016380TAG45195301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016380TATTCT37557731916.67 %66.67 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
4NC_016380AGTA39089181150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016380AGT49799901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_016380ATC4109811091233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_016380CTTT318291839110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
8NC_016380CAAAGA3229323091766.67 %0 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
9NC_016380CTG425622573120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
10NC_016380AGTC3265526651125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
11NC_016380CTAT3271227231225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016380GTA4386038711233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016380TAG4471047201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016380TA6515251631250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016380AAGA3818982001275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
16NC_016380AAAAG3911991331580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016380TAG4914891591233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016380CTGT393819392120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
19NC_016380CT798599871130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
20NC_016380CTTA310083100941225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
21NC_016380AAG411131111421266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016380TAG511282112951433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
23NC_016380GAA411859118701266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
24NC_016380AGAA312700127121375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
25NC_016380TCT41273712748120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_016380TTAC313219132301225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
27NC_016380AT613590136011250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016380ATG413775137851133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
29NC_016380TAT515066150791433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_016380GTAA315765157761250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
31NC_016380T121687516886120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_016380ACATA317251172641460 %20 %0 %20 %7 %Non-Coding
33NC_016380ACCA317520175311250 %0 %0 %50 %0 %Non-Coding
34NC_016380TCT41790617916110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
35NC_016380TA618772187821150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_016380TTTC31918419195120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
37NC_016380TTTC31946819480130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
38NC_016380CTA419556195671233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
39NC_016380TTTA320892209031225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016380TTA622541225581833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
41NC_016380AAG423047230591366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
42NC_016380CTCC32369823708110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
43NC_016380CTT42422324235130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
44NC_016380AGAA324515245261275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
45NC_016380TAC425030250411233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
46NC_016380TA625652256621150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016380TAAG325858258701350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
48NC_016380TTAT326243262551325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
49NC_016380CTT42629726307110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
50NC_016380GTAG326712267241325 %25 %50 %0 %7 %Non-Coding
51NC_016380TAAA326864268751275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016380TTA429281292921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016380AGA430409304201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016380ATA431086310971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016380ACAGA331112311271660 %0 %20 %20 %6 %Non-Coding
56NC_016380TA632308323191250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
57NC_016380AAAGA333347333611580 %0 %20 %0 %0 %Non-Coding
58NC_016380TCTT33396533976120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
59NC_016380AGAAAA334847348651983.33 %0 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
60NC_016380TGAA335563355731150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
61NC_016380GAAT336052360641350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
62NC_016380CAAA336550365621375 %0 %0 %25 %7 %Non-Coding
63NC_016380TTAA436568365831650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
64NC_016380AT636635366451150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
65NC_016380TCT43824138251110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
66NC_016380TCTT33874438754110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
67NC_016380GAA539215392291566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
68NC_016380TA841697417111550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
69NC_016380TCT44190641916110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
70NC_016380AGC442696427061133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
71NC_016380TAT644575445911733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
72NC_016380TCT44494044951120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
73NC_016380TTTG34507245083120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
74NC_016380GAT545202452161533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
75NC_016380AGG445598456091233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016380AGA445791458031366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
77NC_016380AGCG347693477041225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
78NC_016380GCC44877548785110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
79NC_016380CTTT34957349584120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
80NC_016380AAG550048500631666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
81NC_016380CTG45032750338120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
82NC_016380TTC45058050590110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
83NC_016380CTTTT35073350747150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
84NC_016380AAGT351218512291250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
85NC_016380TA651347513571150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016380TTCT35184551856120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
87NC_016380TTTC35223952250120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
88NC_016380AT852444524581550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
89NC_016380AGAA353158531701375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
90NC_016380TACA353767537781250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
91NC_016380TACCT353906539191420 %40 %0 %40 %7 %Non-Coding
92NC_016380TTTC45431254327160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
93NC_016380TTTA355294553051225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
94NC_016380T215790457924210 %100 %0 %0 %4 %Non-Coding
95NC_016380TTTC35806558075110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
96NC_016380CTT55934059354150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
97NC_016380TTCT36226562276120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
98NC_016380AGA462442624521166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016380ATG463066630781333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
100NC_016380GCAA363455634661250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
101NC_016380AAG464767647771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
102NC_016380TTTC36523765249130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
103NC_016380GTA465421654321233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding