ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 39

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016379	TAG	4	3295	3306	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016379	AGA	4	8046	8057	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016379	GAT	4	12257	12267	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016379	TCT	4	14432	14443	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016379	CGT	4	17071	17082	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016379	CAG	4	19925	19936	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016379	CAT	4	21187	21197	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016379	TCC	4	32715	32725	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016379	TAA	4	33450	33460	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016379	TCT	4	34165	34176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016379	ATA	4	34274	34286	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016379	ATA	6	39838	39854	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016379	GCT	4	41369	41380	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016379	ATT	4	45634	45645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016379	TGA	4	46321	46332	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016379	CTC	4	46392	46403	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016379	CTG	4	59263	59273	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016379	AAG	4	59516	59528	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016379	AGT	4	59917	59928	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016379	TCT	4	66775	66785	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016379	CTA	4	68425	68436	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016379	TAT	4	70624	70634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016379	TGA	4	71222	71233	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016379	TAT	4	72079	72089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016379	AGA	4	73313	73324	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016379	TTA	4	74568	74578	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016379	GCA	4	79030	79041	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016379	AGT	4	83169	83181	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016379	TAC	4	85350	85361	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016379	AGA	5	85471	85484	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016379	TAA	4	86248	86258	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016379	CTA	4	91649	91660	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016379	TCT	4	91919	91929	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016379	ACT	4	92900	92910	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016379	CTT	4	93387	93397	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016379	CTA	4	93748	93759	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016379	ATA	4	100374	100384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 39