ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 32

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016378	ACAA	3	122	133	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016378	TGAT	3	1709	1720	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016378	AGGGG	3	1911	1925	15	20 %	0 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016378	TA	6	2101	2111	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016378	TA	6	2505	2515	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016378	TAGG	3	3801	3812	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016378	TTC	4	5001	5013	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016378	CTTTT	3	6119	6132	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016378	TAG	4	6701	6712	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016378	TAG	4	6956	6966	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016378	TTC	4	7104	7115	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016378	CT	6	9342	9352	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016378	AAAG	3	9376	9387	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016378	TCG	4	9515	9526	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016378	CTT	4	9713	9724	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016378	CTTT	3	9880	9890	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016378	CTA	6	11050	11066	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
18	NC_016378	AAGA	3	11628	11639	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016378	AAGA	4	11980	11994	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016378	TA	6	12380	12390	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016378	TAG	4	13340	13351	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016378	A	13	13802	13814	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016378	TTCT	3	14692	14702	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016378	T	16	15100	15115	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016378	AGT	4	15399	15410	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016378	CCATA	3	15416	15429	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016378	AAAG	3	15598	15610	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016378	TTAA	3	15659	15670	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016378	ACTG	3	16038	16049	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016378	T	16	17090	17105	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016378	TTCT	3	17458	17468	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016378	GTTC	3	17541	17551	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016378	CT	6	18712	18722	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016378	CTT	4	19253	19263	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016378	CTTTT	3	20923	20936	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016378	TTCT	3	21228	21238	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016378	TCT	4	22751	22762	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016378	TTC	4	23228	23239	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016378	GA	6	23459	23469	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016378	AGATGC	3	23572	23589	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
41	NC_016378	GAT	4	23736	23747	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016378	GAAA	3	23916	23927	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016378	A	14	25122	25135	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016378	GAA	4	26881	26891	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016378	CTT	4	27136	27147	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016378	A	14	27552	27565	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016378	AAATG	3	27718	27731	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016378	AGA	4	28280	28290	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016378	CA	6	29810	29820	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016378	TAA	4	30889	30900	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016378	GAA	4	30999	31010	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016378	CTCA	3	31859	31870	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016378	ATTT	3	33127	33138	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016378	TCT	4	33213	33224	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016378	GCAT	3	34607	34618	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016378	CTT	4	34900	34912	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016378	TAAA	4	35564	35578	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016378	GGAT	3	35622	35633	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016378	A	15	35671	35685	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016378	ATTCT	3	36645	36658	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016378	TTGC	3	36678	36689	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016378	TAA	4	37575	37586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016378	TTAT	3	38627	38637	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016378	TCCA	3	38706	38717	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016378	TA	6	39347	39358	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016378	TA	6	39405	39415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016378	TAG	4	40007	40017	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016378	CTG	4	40158	40169	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016378	ATG	4	40195	40206	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016378	TTCT	3	40642	40652	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016378	ATTTT	3	41804	41818	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016378	TTAT	3	41889	41899	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016378	TTA	4	44000	44011	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016378	TTTA	3	44083	44095	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016378	CTTT	3	44142	44153	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016378	T	12	45902	45913	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016378	GATT	3	46181	46192	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016378	AATT	3	47426	47438	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016378	TA	7	48374	48386	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016378	TTTAT	3	51560	51574	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016378	CTTT	3	51911	51921	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016378	CTT	4	53453	53465	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016378	ATTAG	3	53958	53971	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016378	TAA	4	54209	54220	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016378	AGT	4	54313	54324	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016378	CAG	4	54334	54345	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016378	AAACA	3	54901	54915	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016378	AAAAT	3	56296	56310	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016378	AAAG	3	56387	56398	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016378	AAT	4	57711	57722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016378	AAG	4	57723	57735	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016378	TTA	4	58168	58179	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016378	GTAA	3	58291	58301	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016378	TTC	4	58342	58353	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016378	CTT	4	59051	59062	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016378	AAAG	3	59167	59178	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016378	TAAA	3	59637	59649	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016378	ATA	4	59654	59666	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016378	AAAG	3	59690	59700	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016378	CCTA	3	60028	60038	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016378	GCT	4	60115	60125	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016378	GAA	4	60127	60138	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016378	AGAC	3	60506	60517	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016378	AGT	4	61775	61786	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016378	AATC	3	64045	64055	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016378	GAA	4	65025	65036	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016378	CT	6	66306	66317	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016378	CTGT	3	67686	67696	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016378	GAA	4	67725	67735	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016378	CTT	4	67854	67864	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016378	ACT	4	67992	68004	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016378	TCT	4	68113	68124	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016378	ATA	4	68466	68478	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016378	GCT	4	68494	68504	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016378	TTC	4	69174	69185	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016378	ATCT	3	69747	69758	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016378	AAT	4	69894	69904	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016378	A	13	70129	70141	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016378	A	12	71004	71015	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016378	AAAT	3	71098	71108	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016378	GCTT	3	71681	71691	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016378	GAA	5	71785	71799	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016378	CAAG	3	72935	72945	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016378	AGA	4	73547	73559	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016378	CAAG	3	73685	73696	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016378	GAAA	3	74654	74664	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016378	TTA	4	75178	75188	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016378	A	15	75739	75753	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016378	CTTT	3	77629	77639	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016378	CAT	4	79248	79259	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016378	T	13	80053	80065	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016378	AGT	4	80512	80522	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016378	AAGA	3	81231	81241	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016378	TGG	4	81998	82009	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016378	AAAGA	3	82090	82104	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016378	TAAA	3	82654	82664	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016378	TA	6	83475	83485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016378	AT	6	83621	83631	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016378	GCC	4	84587	84597	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016378	TACT	3	85535	85546	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 32