ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 11

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016377	AGA	4	1270	1281	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016377	CTT	4	1986	1997	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016377	GAA	4	2253	2264	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016377	TCT	4	3316	3329	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016377	TAT	4	5138	5148	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016377	TAT	4	6654	6665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016377	TCT	4	7696	7706	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016377	TTG	4	10969	10980	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016377	CAT	4	12903	12914	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016377	CTT	4	16691	16701	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016377	GTA	4	18605	18615	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016377	TCA	4	19439	19449	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016377	TCT	4	20994	21005	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016377	CTA	4	25850	25860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016377	GAA	4	32367	32378	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016377	TTA	4	33377	33389	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016377	CTT	4	34614	34624	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016377	GAA	7	36668	36689	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016377	AGA	4	41895	41906	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016377	GAT	4	44949	44960	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016377	TCT	4	47929	47940	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016377	ATG	4	48196	48207	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016377	ATC	4	50584	50594	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016377	AGA	4	50937	50947	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016377	TCT	4	53442	53452	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016377	ACC	4	54996	55007	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016377	ATA	5	57448	57461	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016377	AAT	4	58105	58117	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016377	CTC	4	62104	62114	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016377	ATA	4	63448	63460	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016377	TAT	5	64737	64750	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016377	TCT	4	66609	66620	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016377	CCT	4	70659	70670	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016377	CTT	4	71180	71192	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016377	TCT	4	72055	72066	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016377	CTT	4	74037	74048	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016377	CTA	4	75754	75765	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016377	CTT	4	76186	76198	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016377	AGT	4	76679	76689	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016377	TTA	4	77946	77956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016377	TAA	4	78531	78542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016377	CTT	4	81157	81167	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016377	TCT	4	81718	81729	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016377	CCA	4	83946	83957	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016377	GTT	4	84162	84173	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016377	AGA	4	85497	85507	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016377	TAA	5	85855	85869	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016377	TTC	4	89577	89587	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016377	CTA	4	89866	89876	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016377	ATA	4	89876	89887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016377	CGG	4	89916	89926	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016377	ATT	4	90713	90723	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016377	TAT	4	93205	93217	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016377	ATT	4	95500	95510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016377	ATA	4	95521	95532	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016377	ATA	4	96636	96646	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016377	TCT	4	105134	105145	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016377	CAA	4	105959	105970	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016377	CTC	4	107869	107879	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016377	AGA	4	110632	110642	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016377	ATA	4	111451	111462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016377	TAG	4	111957	111968	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016377	GAA	4	112018	112028	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016377	TAA	4	114428	114438	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016377	GGT	4	118854	118865	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016377	GAT	4	122832	122843	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016377	AGA	4	125151	125162	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016377	CAT	4	125401	125412	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016377	TTC	4	125616	125627	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016377	CTT	4	125813	125824	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016377	ATA	5	126716	126730	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016377	ATC	5	127533	127546	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016377	AAG	4	129103	129114	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016377	TAA	4	129900	129911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 11