ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 50

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016375	AAG	4	13	24	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016375	TGA	4	701	711	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016375	AAG	4	1426	1436	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016375	GAA	4	2040	2050	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016375	GAA	4	2084	2094	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016375	TCT	5	5040	5054	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016375	TGA	4	5676	5687	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016375	AGA	4	6548	6560	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016375	ATA	5	8936	8951	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016375	ATC	4	10189	10200	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016375	ATG	4	11755	11766	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016375	AGA	4	12616	12626	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016375	TTA	4	14515	14525	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016375	ATC	4	14560	14571	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016375	AGA	4	15809	15821	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016375	TAC	5	16726	16739	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016375	CTT	4	18081	18092	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016375	AAT	4	18886	18896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016375	ATC	4	20823	20834	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016375	TTA	4	21724	21734	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016375	TGG	4	22448	22459	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016375	ATA	4	25618	25628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016375	CAT	4	35372	35382	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016375	TAT	4	38600	38610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016375	CTT	4	45851	45862	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016375	CTT	4	46967	46978	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016375	CCT	4	47117	47127	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016375	ATC	4	49241	49252	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016375	CCT	4	50304	50315	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016375	CTT	5	53858	53871	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016375	TAT	4	59678	59688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016375	AGA	4	63285	63297	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016375	TAG	4	64530	64540	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016375	AGA	4	65790	65801	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016375	ACT	4	67423	67434	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016375	ATA	4	70795	70806	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016375	CTT	4	72562	72573	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016375	GTT	4	72857	72868	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016375	CTT	4	72946	72958	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016375	CAA	4	74460	74471	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016375	TAT	6	74890	74906	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016375	TGA	4	76168	76178	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016375	GAC	4	82378	82388	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016375	AGA	4	83864	83874	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016375	TTC	4	88914	88924	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016375	TCT	4	91325	91336	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016375	TTA	4	91817	91828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 50