ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 50

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016375	AT	6	1	12	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016375	AAG	4	13	24	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016375	AG	6	323	334	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016375	TGA	4	701	711	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016375	AAG	4	1426	1436	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016375	GAA	4	2040	2050	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016375	GAA	4	2084	2094	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016375	AAAG	3	2103	2114	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016375	AG	6	2378	2388	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016375	AAAG	3	3154	3165	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016375	AG	6	3282	3292	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016375	CTTT	5	3831	3849	19	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016375	AT	6	5029	5039	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016375	TCT	5	5040	5054	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016375	TGA	4	5676	5687	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016375	TA	7	5729	5741	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016375	AGA	4	6548	6560	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016375	TTCT	3	7347	7357	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016375	TTCT	3	8486	8497	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016375	TTTAT	3	8870	8883	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016375	ATA	5	8936	8951	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016375	ATC	4	10189	10200	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016375	TA	7	10510	10522	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016375	TTTTG	3	11115	11129	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016375	ATG	4	11755	11766	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016375	AGA	4	12616	12626	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016375	AAGA	3	13978	13988	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016375	TTA	4	14515	14525	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016375	ATC	4	14560	14571	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016375	A	14	15385	15398	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016375	AGA	4	15809	15821	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016375	A	14	16027	16040	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016375	CAAG	3	16710	16720	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016375	TAC	5	16726	16739	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016375	TC	6	17168	17179	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016375	CACG	3	17509	17520	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016375	AAAG	4	17686	17701	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016375	CTT	4	18081	18092	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016375	TA	6	18128	18138	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016375	AAT	4	18886	18896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016375	CCTTTA	3	19587	19604	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016375	AAAT	3	20374	20386	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016375	AT	7	20788	20800	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016375	ATC	4	20823	20834	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016375	TTA	4	21724	21734	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016375	TGG	4	22448	22459	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016375	GCTC	3	22561	22573	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016375	CTTT	4	23713	23727	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016375	CTTTA	3	24153	24168	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016375	GAAA	3	24280	24290	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016375	AAGT	3	24495	24506	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016375	AAGAA	3	24624	24637	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016375	A	12	24643	24654	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016375	ATA	4	25618	25628	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016375	GAAA	3	27700	27710	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016375	TAAG	3	29373	29384	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016375	T	12	30641	30652	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016375	TGAA	3	30763	30774	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016375	ACCT	3	33938	33949	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016375	GA	6	33968	33978	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016375	GCAA	3	35032	35042	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016375	CGAT	3	35331	35343	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016375	CAT	4	35372	35382	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016375	AAGA	3	37043	37054	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016375	TGAC	3	38078	38088	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016375	TAT	4	38600	38610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016375	TTAGG	3	38675	38688	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016375	A	13	39015	39027	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016375	AAGG	3	39064	39075	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016375	TTCT	3	39346	39357	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016375	AAAT	3	39800	39811	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016375	CTTA	3	42000	42011	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016375	GACT	3	43485	43497	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016375	TGAA	3	43511	43522	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016375	CGAA	3	43537	43547	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016375	A	14	45067	45080	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016375	CTT	4	45851	45862	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016375	CTTC	3	45962	45973	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016375	CTT	4	46967	46978	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016375	CCT	4	47117	47127	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016375	TATTTA	3	47160	47177	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_016375	ACGA	3	47640	47651	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016375	ATC	4	49241	49252	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016375	CCT	4	50304	50315	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016375	ACTTTT	3	51795	51811	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
86	NC_016375	A	14	53122	53135	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016375	CTT	5	53858	53871	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016375	TACTA	4	55831	55851	21	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016375	CT	6	56046	56056	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016375	TA	7	56932	56944	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016375	AAAG	3	57635	57645	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016375	ACTC	3	58119	58129	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016375	T	14	58249	58262	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016375	A	13	58488	58500	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016375	ATTTT	3	59015	59029	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016375	GAAGA	3	59030	59043	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016375	TAT	4	59678	59688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016375	CA	6	61738	61748	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016375	TACT	3	62450	62460	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016375	T	12	62786	62797	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016375	AGA	4	63285	63297	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016375	TAATG	3	64038	64052	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016375	TAG	4	64530	64540	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016375	A	13	65333	65345	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016375	AGA	4	65790	65801	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016375	ACT	4	67423	67434	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016375	CTTA	3	68665	68676	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016375	TA	6	70782	70792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016375	ATA	4	70795	70806	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016375	AAAG	3	70807	70818	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016375	GCTT	3	72413	72423	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016375	CTT	4	72562	72573	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016375	CTTT	3	72607	72617	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016375	GTT	4	72857	72868	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016375	CTT	4	72946	72958	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016375	CAA	4	74460	74471	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016375	TAT	6	74890	74906	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016375	A	13	75555	75567	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016375	TGA	4	76168	76178	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016375	GCAA	3	76255	76265	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016375	TTCT	3	77148	77158	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016375	ATCT	3	77909	77920	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016375	TTCC	3	79434	79445	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016375	T	12	79549	79560	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016375	TGAA	3	81663	81673	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016375	TATC	3	81756	81767	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016375	AAAGA	3	81844	81857	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016375	GAC	4	82378	82388	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016375	AAGA	3	82805	82816	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016375	TTGC	3	83460	83471	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016375	CTTT	3	83483	83494	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016375	AGA	4	83864	83874	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016375	CTTT	3	84712	84722	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016375	CTTT	3	84786	84798	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016375	A	14	85267	85280	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016375	TGATA	3	86473	86487	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016375	TA	6	87849	87859	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016375	TTC	4	88914	88924	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016375	A	12	89745	89756	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016375	TCT	4	91325	91336	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016375	CTAG	3	91437	91449	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016375	T	16	91721	91736	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016375	TTA	4	91817	91828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 50