ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 28

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016374	AT	6	2	13	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016374	AAG	4	14	25	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016374	AG	6	324	335	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016374	TGA	4	702	712	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016374	AAG	4	1427	1437	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016374	GAA	4	2041	2051	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016374	GAA	4	2085	2095	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016374	AAAG	3	2104	2115	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016374	AG	6	2379	2389	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016374	AAAG	3	3155	3166	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016374	AG	6	3283	3293	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016374	CTTT	5	3832	3850	19	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016374	TTTTC	3	4764	4778	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016374	TTC	4	5429	5439	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016374	T	13	8690	8702	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016374	AT	6	12776	12786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016374	AACC	3	12837	12849	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016374	TAT	4	13132	13143	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016374	TG	6	13468	13479	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016374	A	13	14314	14326	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016374	GAAA	3	15606	15618	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016374	TGA	4	16013	16023	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016374	T	12	17802	17813	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016374	TC	6	18589	18599	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016374	TA	6	19660	19670	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016374	TTA	4	19766	19777	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016374	GAATTA	3	20290	20308	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_016374	AGT	4	20910	20921	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016374	TA	6	21394	21404	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016374	AT	6	21580	21590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016374	AACT	3	25145	25157	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016374	TAAG	3	25237	25248	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016374	GTAG	3	25724	25735	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016374	GAAA	3	26461	26473	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016374	AG	6	26810	26820	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016374	ATA	4	27204	27214	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016374	TTC	4	28759	28770	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016374	ATA	4	32566	32576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016374	GAAAT	3	32700	32713	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016374	TGA	4	33257	33268	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016374	AGA	4	33382	33393	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016374	ATA	5	33850	33864	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016374	AGA	4	34475	34486	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016374	CTT	4	35214	35225	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016374	TA	6	35680	35690	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016374	AAGA	3	36376	36387	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016374	AAT	4	36531	36541	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016374	GAA	4	36633	36645	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016374	TAA	4	36709	36719	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016374	AAAGC	3	36984	36997	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016374	ATAA	3	37960	37971	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016374	AAAAG	3	38820	38834	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016374	TTTC	3	38925	38936	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016374	TA	7	39062	39074	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016374	ATAG	3	39207	39218	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016374	TTTA	3	41325	41336	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016374	AG	6	41507	41518	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016374	TA	6	42380	42391	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016374	TTA	4	42572	42583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016374	TCT	4	43744	43754	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016374	TAT	4	44968	44978	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016374	ATAG	3	45675	45686	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016374	AGA	4	46417	46428	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016374	ATAA	3	47617	47628	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016374	T	12	47806	47817	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016374	TTTCT	3	47886	47900	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016374	AAGG	3	48595	48607	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016374	GGATA	3	48721	48734	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016374	CAAT	3	48801	48812	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016374	TTA	4	50654	50665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016374	AGA	4	51972	51983	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016374	TATAAA	3	52086	52104	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_016374	TCT	4	52300	52310	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016374	TCTT	3	53437	53449	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016374	TCCT	3	53761	53773	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016374	TTTCC	3	53785	53799	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016374	TACTT	3	54313	54326	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016374	GTTC	3	54963	54973	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016374	TATTT	3	55544	55558	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016374	AAAAGA	3	55664	55681	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016374	GAA	4	56694	56705	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016374	AAAG	3	56866	56876	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016374	AT	6	57089	57100	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016374	CTTA	4	58252	58267	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016374	ATCT	3	59905	59915	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016374	TCT	4	60482	60493	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016374	GAA	4	60695	60706	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016374	AAG	4	60812	60822	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016374	TCTT	3	61928	61940	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016374	CTTT	3	64150	64160	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016374	TTCT	3	64317	64328	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016374	CTT	4	65035	65045	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016374	AAAAG	3	65389	65403	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016374	TTAA	3	68025	68037	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016374	GACAA	3	68273	68286	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016374	AGAA	3	68773	68784	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016374	TTTA	3	69046	69056	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016374	TTATT	3	69531	69546	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016374	CGT	4	72288	72298	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016374	AAGG	3	72658	72669	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016374	TA	6	73511	73522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016374	CTTT	5	74999	75018	20	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016374	CT	6	75597	75608	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016374	CTT	4	77247	77257	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016374	TAAAAA	3	77339	77356	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_016374	AAG	4	77357	77368	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016374	ATG	4	77380	77391	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016374	CTT	4	77477	77488	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016374	A	12	77734	77745	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016374	AGT	4	77837	77847	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016374	AAAAG	3	78675	78688	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016374	TAT	4	79837	79849	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016374	TATAGT	3	80379	80395	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_016374	CTT	4	80420	80431	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016374	TTA	4	80525	80535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016374	TTCT	3	81232	81242	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016374	CCTAT	3	82222	82235	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016374	AG	6	82300	82311	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016374	GAAA	3	83579	83589	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016374	GAACT	3	83990	84003	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016374	C	12	84028	84039	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016374	A	17	84040	84056	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
123	NC_016374	TAAAA	3	84734	84747	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016374	TCTCAC	3	85671	85687	17	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016374	TA	7	89345	89357	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016374	TACT	4	90214	90230	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
127	NC_016374	A	14	90761	90774	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016374	TA	6	91159	91169	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016374	AT	6	91684	91696	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016374	TTCT	3	92139	92150	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016374	AAAC	3	92878	92889	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016374	TTGG	3	92900	92910	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016374	ATCT	3	93495	93506	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016374	CCTT	3	93648	93658	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016374	A	12	93714	93725	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016374	TTA	4	93809	93820	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016374	CAAA	3	95078	95088	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016374	TTC	5	95575	95589	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016374	TTTA	3	97036	97048	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016374	TA	6	97573	97583	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016374	TA	8	97709	97726	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
142	NC_016374	CAAA	3	98674	98684	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 28