ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 57

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016373	CTT	4	189	201	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016373	CTC	4	603	613	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016373	AGA	4	8839	8851	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016373	AGA	4	9913	9924	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016373	ATT	4	10436	10446	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016373	TAC	4	11062	11072	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016373	TTA	4	12026	12036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016373	AAG	4	12241	12252	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016373	TGA	4	12929	12939	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016373	AAG	4	13654	13664	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016373	GAA	4	14268	14278	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016373	GAA	4	14312	14322	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016373	TCA	4	16950	16960	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016373	ACT	4	17200	17210	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016373	AGT	4	38880	38892	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016373	CTT	4	42856	42868	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016373	GAA	4	44933	44945	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016373	CAC	4	45373	45383	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016373	CTT	4	47070	47080	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016373	GAA	4	47093	47103	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016373	TCT	4	47455	47467	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016373	GCC	4	48538	48548	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016373	ATA	4	50216	50228	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016373	AGT	4	51904	51914	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016373	ATT	4	55427	55438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016373	TGA	4	57114	57125	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016373	AGA	4	58053	58064	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016373	AAG	4	63588	63599	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016373	CTT	4	63864	63874	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016373	CCT	4	64211	64221	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016373	GAT	4	67357	67367	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016373	CTT	4	69221	69232	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016373	TAT	4	70433	70444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016373	TAA	4	70592	70603	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016373	TAC	4	70738	70749	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016373	TTA	5	73598	73612	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016373	TAT	4	73704	73714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 57